Самой лучшей CRM-системы не бывает. Бывает «более подходящая» и «менее походящая» для данного бизнеса. «Допиливать» и «дотачивать» придется в любую – другое дело, что одну надо два раза напильником шлифануть, чтобы получить нужный вариант, а другую на изнанку вывернуть...
Практические все платные CRM системы, которые популярны на рынке отлично работают с 1С, надо изучить ваши задачи, скорее от этого зависит. так же вам необходимо писать подробно ТЗ для компании которая будет заниматься внедрением CRM в 1С...