Предлоги in и at - семантический дублет. Это значит, что они согласуют слова в предложении, но одновременно с этим работают как переключатели смысла в согласуемых словах. Если сказать Mary is at school, то носитель по предлогу at поймет, что school является метонимией "учебы", что фактически означает Mary is studying или Mary is a school-girl...

Учеба в школе редко ограничивается только уроками и контрольными. Здесь зарождаются первые крепкие дружбы, случаются робкие признания в симпатии, происходят серьезные стычки и накапливается опыт, который потом помогает справляться со взрослой реальностью. Но школьные истории бывают разными: в одних коридорах царит порядок и планы на будущее строятся с педантичной точностью, в других перемены превращаются в хаос списывания и проделок, а кое-где за дверью класса уже может поджидать маньяк с ножом...