В устной речи нам не важно, оба слова звучат одинаково, а вот при письме надо учитывать, что, хотя они и используются одинаково полноправно, но их написание (слитно или раздельно) регулируется определёнными правилами...
Часто даже самые, казалось бы, грамотные люди допускают здесь ошибку. Независимо от того, какой частью речи является «как будто» в предложении (союзом или частицей), пишется всегда одинаково — раздельно, никаких дефисов! Правильно: как будто Как будто надо ставить дефис, но на самом деле не надо ставить дефис. Слово «как» действительно пишется с дефисом, если за ним идут частицы -то, -либо, -нибудь. Видимо, поэтому мы автоматически тянемся поставить дефис во всех похожих словах...