Осторожно, спойлеры! Действие игры происходит вскоре после событий фильма «Звёздные войны. Эпизод III: Месть ситхов». После объявленного императором Палпатин «Приказа 66» большинство джедаев было убито, и главный герой игры, молодой падаван по имени Кэл Кестис (англ. Cal Kestis) вынужден уйти в подполье и скрываться, спасая свою жизнь. В соответствии с описанием разработчиков, в ходе игры герой должен завершить своё обучение и овладеть искусством владения световым мечом. Кэла Кестиса в игре озвучил американский актёр Камерон Монахэн...

Кэл и BD почти добрались до следующий гробницы, когда на них напали братья ночи. Друзья уцелели, однако были вынуждены углубиться в опасные датомирские болота. Меррин вновь нашла Кэла и BD и наслала на них сестер ночи — нежить...