Найти в Дзене
30 подписчиков

Твой компьютер примеряет молекулы к вирусу. Буквально.


В Петрозаводске, в Институте математических исследований КарНЦ РАН, в 2020 году поставили задачу: нет миллиардов на суперкомпьютер — есть вирус, есть белок-мишень и библиотека из сотен миллионов молекул-кандидатов. Нужно примерить каждую.

Так появился SiDock@home.

Метод — молекулярный докинг: хост симулирует, как малая молекула «входит» в активный карман белка вируса. Точно совпала — потенциальный ингибитор. Нет — следующая. Один хост: 100–500 проверок. Тысячи хостов — сотни миллионов.

COVID первым. Потом проект расширился. Сейчас на очереди — гликопротеин Эболы GP1: участники сами выбрали следующую цель голосованием.

Для Raspberry Pi и одноплатников — отдельное ARM-приложение: задачи в 5 раз меньше обычных. Каждый хост считается.

В конце апреля — командное соревнование. Хороший момент подключиться.
Твой компьютер примеряет молекулы к вирусу. Буквально.
Около минуты