После смерти сотрудника удержать НДФЛ можно, только если работник был жив на дату выплаты дохода, ведь обязанность по уплате НДФЛ прекращается со смертью физлица (подп. 3 п. 3 ст. 44, п. 2 ст. 223 и п. 1 ст. 424 НК РФ).