Государственное бюджетное учреждение может оплатить за счёт субсидии выполнение государственного задания разработку проектно-сметной документации на текущий ремонт здания, так как ремонт зданий есть в расчетах фин.обеспечения госзадания (методические рекомендации доведенные письмом Минфина от 01.10.2014 № 02-01-09/49180). Однако сначала следует убедиться, что ремонт кровли действительно является текущим, а не капитальным.