Не стоит надеяться лишь на главную страницу сайта. Сама по себе она не поможет выйти WEB проекту в ТОП3 Яндекс. Для её усиления нужно иметь большое количество дополнительных релевантныхстраниц. Было бы очень нелогично, если по всем запросам Яндекс выдавал бы только главный URL.