Мазина П.С., Заварыкина Т.М., Ходырев Д.С., Розанова О.А., Артамонова Е.В., Стенина М.Б., Хохлова С.В.
Доклад, представленный на конкурсе научных работ имени Е.Б. Бурлаковой, был посвящён результатам изучения динамики концентрации циркулирующей опухолевой ДНК (цоДНК) в ходе неоадъювантной (предоперационной) лекарственной терапии у больных тройным негативным раком молочной железы, который характеризуется агрессивной опухолью, чаще возникающей в раннем возрасте, и неблагоприятным прогнозом.
В ходе исследования коллектив разработал методический подход к анализу цоДНК, включающий выделение ДНК из цельной крови и опухолевой ткани, выделение внеклеточной ДНК из плазмы крови на разных этапах лечения, отбор соматических (имеющихся только в опухолевой ткани) мутаций по данным полноэкзомного секвенирования (определения последовательности всей кодирующей части генома) и их детекцию методом цифровой ПЦР.
Циркулирующая опухолевая ДНК — это фракция внеклеточной ДНК, происходящая из опухолевых клеток, которая содержит генетические изменения, идентичные тем, которые содержит опухолевая ткань. Короткое время жизни цоДНК в кровотоке даёт возможность использовать её для мониторинга онкологических заболеваний в реальном времени. Основное требование к методу определения цоДНК — высокая аналитическая чувствительность, поскольку содержание цоДНК в плазме крови не превышает 1% от всей внеклеточной ДНК.
Цифровая ПЦР, использованная в работе, представляет собой метод абсолютного количественного определения нуклеиновых кислот, основанный на разделении исходной реакционной смеси на множество отдельных микрореакций (до 30 000 реакций), в каждой из которых происходит амплификация ДНК, то есть многократное увеличение числа копий заданного фрагмента ДНК. Чувствительность системы позволяет детектировать 2–3 мутации в 1 мкл образца ДНК.
Полученные количественные результаты определения цоДНК в плазме крови пациенток с тройным негативным раком молочной железы в динамике были сопоставлены с выраженностью лекарственного патоморфоза опухоли, отражающей ответ опухоли на терапию, а именно, количество живых опухолевых клеток после завершения неоадъювантной химиотерапии и операции. У пациенток, достигших полной патоморфологической регрессии (pCR), то есть при отсутствии живых опухолевых клеток после завершения лечения, наблюдалось существенное снижение количества цоДНК к временной точке смены блоков химиотерапии и после завершения лечения, в некоторых случаях с резким подъемом на начальных этапах терапии. У пациенток, для которых не выявлено достижение pCR, уровень цоДНК повышался в ходе лечения. По полученным данным наиболее информативными временными интервалами представляются периоды после завершения первого блока химиотерапии и перед оперативным вмешательством.
Заварыкина Т.М., Мазина П.С., Пронина И.В., Розанова О.А., Московцев А.А., Зайченко Д.М., Ходырев Д.С., Стенина М.Б., Колядина И.В., Хохлова С.В., Артамонова Е.В. Оценка цоДНК в ходе первичного лечения больных тройным негативным раком молочной железы: научная новизна и клинические перспективы. Современная онкология. 2025. Т.27, №4. С.326–330. DOI: 10.26442/18151434.2025.4.203515
#наукаИБХФ #публикацииИБХФ #ИБХФ #ИБХФРАН