Специалисты подведомственного Россельхознадзору ФГБУ «ВНИИКР» разработали уникальную базу данных для диагностики бактериальных болезней

26 марта в ФГБУ «ВНИИКР» поступила информация о получении
патента на созданную учеными учреждения специализированную базу данных
(Патент на базу данных № 2025626024), предназначенную для идентификации
возбудителей бактериальных болезней растений методом времяпролётной
масс-спектрометрии (MALDI-TOF).

Разработка позволит значительно повысить точность и надежность результатов фитосанитарной диагностики.

До настоящего времени метод MALDI-TOF широко применялся для
идентификации микроорганизмов в медицине, пищевой и промышленной
микробиологии, реже для диагностики бактериальных болезней растений
из-за отсутствия в открытых базах данных эталонных спектров
фитопатогенов.

В основу разработки легли 115 белковых спектров типовых и референтных
штаммов, идентификация которых подтверждена с помощью секвенирования и
видоспецифичных ПЦР-тестов. Библиотека охватывает широкий круг
карантинных и особо опасных фитопатогенных бактерий, включая роды
Acidovorax, Clavibacter, Dickeya, Erwinia, Pantoea, Pectobacterium,
Pseudomonas, Ralstonia, Xanthomonas, Xylella и другие.

Ключевая особенность разработки — унификация условий культивирования и
пробоподготовки. Специалистами была подобрана универсальная питательная
среда и стандартизированы параметры выращивания бактерий, что
минимизирует влияние метаболического статуса клеток на белковый профиль.
Кроме того, для получения эталонных спектров использовался метод
экстракции, обеспечивающий эффективную очистку белков от примесей. Такой
подход гарантирует достоверность результатов.

База данных интегрирована с приборами Autobio Diagnostics и функционирует под управлением программы Autof Anylazer.

Разработка предназначена для использования в лабораториях, оснащенных
масс-спектрометрами, и может применяться как для идентификации
карантинных, так и иных экономически значимых бактериальных патогенов
растений.

Внедрение базы данных позволит сократить сроки проводимых
исследований, а также снизить риски распространения опасных бактериозов
сельскохозяйственных культур.