Учёные БГМУ Минздрава России разработали экономичный и точный тест для определения уровня Akkermansia muciniphila («бактерии стройности») в организме. Разработка выполнена в лаборатории микробиома человека в Межвузовском студенческом кампусе.
Akkermansia muciniphila (от 1% до 4% микробиоты кишечника) важна для здоровья: её недостаток связан с ожирением, диабетом 2‑го типа и воспалениями кишечника, а избыток — с риском онкологии.
Раньше точно подсчитать эту бактерию в образцах было сложно: как строгий анаэроб, она тяжело поддавалась идентификации. Полногеномное секвенирование — единственный надёжный метод — оказалось слишком долгим и дорогим для регулярной диагностики.
Команда ученых БГМУ Минздрава России вышла за рамки существующих аналогов. Если ранее исследования позволяли подобрать праймеры только к роду бактерий, то башкирские ученые разработали нуклеотидные праймеры и зонды для вида Akkermansia muciniphila.
Новая тест-система на основе полимеразной цепной реакции работает по принципу, схожему с тестами на коронавирус, но нацелена на выявление конкретной бактерии. Это позволяет проводить как качественный, так и количественный анализ.
Внедрение разработки открывает эру доступной персонализированной диагностики. Тест-система БГМУ Минздрава России значительно дешевле секвенирования, что делает мониторинг состояния микробиоты доступным для клиник и научных центров.
Разработка имеет двойное назначение с одной стороны – это объективный мониторинг эффективности терапии для пациентов с метаболическими нарушениями, с другой - фармацевтические компании смогут использовать тест для проверки наличия и количества штамма в пробиотических препаратах перед регистрацией и выпуском на рынок.
Успеху исследования способствовала поддержка в рамках программы стратегического академического лидерства «Приоритет-2030». Благодаря финансированию в лабораторию было закуплено современное анаэробное оборудование, позволяющее работать с чувствительными культурами.
«Мы не просто нашли бактерию, мы нашли применение этому знанию. Тест-система поможет врачам управлять микробиомом для профилактики целого спектра социально значимых заболеваний», ректор БГМУ Минздрава России, академик РАН, профессор Валентин Павлов.
Ученые Университета сделали шаг к импортозамещению в сфере медицинской диагностики и созданию новых подходов к лечению через управление микробиотой человека.