Сквозной проток в южной (левой) части дельты Невы представляет собой впадающий в Большую Неву правый рукав Фонтанки. Первоначально река вытекала из болота, существовавшего на месте современного Марсового поля и Михайловского сада. Длина — 4,67 км., ширина от 20 до 40 м, глубина до 3,2 м. До основания города и вплоть до 1726 г. река называлась Мья, от ижорского «муя» — «грязная». После соединения в 1711 г. с Фонтанкой вода в реке стала проточной и, соответственно, менее мутной. Возможно, после этого непривычное для русского слуха слово «мья» трансформировалось постепенно в «Мойку». 1720 г. — созданы первые деревянные набережные Мойки.
1798–1811 гг. — сооружены гранитные набережные от реки Фонтанки до современного Английского пр. (левый берег) и Крюкова канала (правый берег).
1975 г. — сооружена набережная от пр. Маклина (ныне Английский проспект) до реки Пряжки.
Через реку переброшено 15 мостов. От Мойки отходят Зимняя и Лебяжья канавки, соединяющие ее с Невой, а также канал Грибоедов