Добавить в корзинуПозвонить
Найти в Дзене
У Клио под юбкой

Происхождение жизни: как Крик, Опарин и грибок микориза разрушили три главных упрощения биологии

Советский академик Александр Опарин и британец Джон Холдейн сформулировали свои гипотезы о происхождении жизни независимо друг от друга в 1920-х годах, не зная о работах один другого. Суть была одинаковой: около 4 миллиардов лет назад в первичном земном океане, атмосфера над которым состояла из метана, аммиака, водорода и углекислого газа, под воздействием ультрафиолета и электрических разрядов из неорганических соединений начали образовываться органические молекулы. Океан превращался в химический бульон, бульон усложнялся, и в какой-то момент из него появилась первая живая клетка. В 1953 году американский химик Стэнли Миллер поставил опыт, который, казалось, подтвердил эту модель: он смешал в колбе воду, метан, аммиак и водород, пропустил электрические разряды — и получил несколько аминокислот, строительных блоков белков. Новости были на первых полосах. Жизнь синтезируют в лаборатории. Проблема возникла позже. Аминокислот в клетке — двадцать стандартных типов. Из них строятся белки —
Оглавление

Магический бульон и его пределы

Советский академик Александр Опарин и британец Джон Холдейн сформулировали свои гипотезы о происхождении жизни независимо друг от друга в 1920-х годах, не зная о работах один другого. Суть была одинаковой: около 4 миллиардов лет назад в первичном земном океане, атмосфера над которым состояла из метана, аммиака, водорода и углекислого газа, под воздействием ультрафиолета и электрических разрядов из неорганических соединений начали образовываться органические молекулы. Океан превращался в химический бульон, бульон усложнялся, и в какой-то момент из него появилась первая живая клетка.

В 1953 году американский химик Стэнли Миллер поставил опыт, который, казалось, подтвердил эту модель: он смешал в колбе воду, метан, аммиак и водород, пропустил электрические разряды — и получил несколько аминокислот, строительных блоков белков. Новости были на первых полосах. Жизнь синтезируют в лаборатории.

Проблема возникла позже. Аминокислот в клетке — двадцать стандартных типов. Из них строятся белки — цепочки от нескольких десятков до нескольких тысяч аминокислот. Белки существуют только в том случае, если каждая аминокислота занимает строго определённое место в цепочке: замена одной на другую меняет или разрушает функцию. Вопрос, который встал перед исследователями: каким образом цепочки правильно собираются? Это не вопрос химии — это вопрос информации. И ответа на него в рамках «бульонной» модели найдено не было.

Что открыли Уотсон и Крик — и чего это объяснить не смогло

В том же 1953 году, несколькими месяцами раньше опыта Миллера, Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик опубликовали статью в Nature с описанием двойной спирали ДНК. За это открытие они получили Нобелевскую премию в 1962 году.

Но вместе с ответом на один вопрос открытие поставило новый, куда более трудный. ДНК — это не просто молекула. Это носитель записи. Четыре азотистых основания — аденин, тимин, гуанин и цитозин — выступают в роли букв алфавита. Их трёхбуквенные сочетания («кодоны») кодируют конкретные аминокислоты. Цепочки кодонов задают последовательность сборки белка. Вся эта система работает так же, как письменный язык: есть алфавит, есть слова, есть грамматика, есть текст.

И здесь возникает проблема, которую Крик сформулировал с прямотой, нехарактерной для осторожных академических текстов. Когда его спросили, могла ли эта система возникнуть случайно — в результате случайных химических реакций в первичном океане, — он ответил коротко: нет. Не «маловероятно», не «требует дополнительного изучения» — нет.

Чтобы понять, почему, достаточно одного расчёта. Типичный функциональный белок содержит несколько сотен аминокислот. Вероятность случайной сборки даже короткого функционального белка из 150 аминокислот в правильной последовательности — это примерно 1 к 10 в степени 195. Для сравнения: число атомов во всей видимой вселенной оценивается примерно в 10 в степени 80. Случайная сборка белка с нужной функцией статистически невозможна не потому что мало времени, а потому что пространство вариантов непропорционально больше любого мыслимого числа попыток.

Это не аргумент против материализма. Это аргумент против конкретной модели — случайной химической сборки. Наука честно признаёт: механизм первоначального возникновения генетического кода не известен. Этот пробел существует, и закрыть его пока нечем.

Что предлагает современная наука вместо «бульона»

Вопрос о происхождении жизни не закрыт, но не пуст. За последние полвека появилось несколько альтернативных гипотез, каждая из которых решает часть проблемы.

Гипотеза «мира РНК» предполагает, что первичными молекулами были не ДНК и не белки, а РНК — молекула, способная одновременно хранить информацию и выполнять каталитические функции. В 1989 году Томас Чех и Сидни Олтман получили Нобелевскую премию за открытие рибозимов — молекул РНК, способных действовать как ферменты. Это сделало гипотезу «мира РНК» одной из наиболее перспективных: если РНК умеет и хранить информацию, и катализировать реакции, то отдельные белки для начала могли быть не нужны.

Другое направление — абиотический синтез в гидротермальных жерлах на дне океана. В 1977 году была открыта первая гидротермальная система — «чёрные курильщики» у Галапагосских островов. Оказалось, что на глубине нескольких километров, без солнечного света, в условиях высоких температур и давлений, существуют сложные экосистемы, работающие на химической энергии. Некоторые исследователи полагают, что именно такие среды — с градиентами pH, концентрированными минеральными растворами и пористыми структурами — обеспечивали условия для первой химии жизни.

Нидерландские учёные в 1984 году, работая в гелиевом криостате с условиями, имитирующими межзвёздное пространство — вакуум, сверхнизкие температуры, ультрафиолетовое излучение, — получили сложные органические молекулы, включая карбоксильные кислоты и аминогруппы. Это подтвердило: для синтеза органики не нужен ни океан, ни Земля. Нужные молекулы образуются в космосе сами. Это поставило вопрос иначе: возможно, жизнь не возникла на Земле, а была занесена вместе с органическими молекулами на метеоритах или кометах — панспермия в её химической форме, без каких-либо микроорганизмов.

Дарвин: что он на самом деле утверждал и где это работает

Разговор о происхождении жизни часто соскальзывает в разговор об эволюции, хотя это разные вопросы. Происхождение жизни — это вопрос о том, как появилась первая клетка. Эволюция — о том, что происходило дальше.

Теория Дарвина описывает второй вопрос, не первый. «Происхождение видов» 1859 года начинается с уже существующих организмов: механизм изменчивости, наследственности и отбора объясняет, как одни виды дают начало другим, но не объясняет, откуда взялась первая жизнь. Это разграничение нередко смешивается в популярных дискуссиях к взаимному ущербу обеих тем.

Там, где теория эволюции работает, она работает хорошо. Бактерии приобретают устойчивость к антибиотикам — это наблюдаемый, воспроизводимый эволюционный процесс. Искусственный отбор за несколько тысяч лет превратил волка в таксу и дога — два существа, которые смотрятся друг на друга с одинаковым недоумением. Геномный анализ подтверждает родство организмов в точном соответствии с эволюционным деревом: ДНК человека и шимпанзе совпадают примерно на 98,7%. ДНК человека и банана — примерно на 60%. Не потому что мы похожи на банан, а потому что у нас общие молекулярные механизмы клеточного дыхания.

Где возникают трудности — это на уровне механизма крупных изменений. Дарвин предполагал, что всё новообразование идёт постепенно — через цепь малых шагов, каждый из которых чуть улучшает приспособленность. Палеонтологическая запись, однако, показывает иную картину: виды существуют долго без видимых изменений, а потом относительно быстро сменяются новыми. Это назвали «пунктуированным равновесием» — Стивен Джей Гулд и Найлс Элдридж сформулировали эту концепцию в 1972 году. Скачкообразные изменения не противоречат отбору — они просто говорят о том, что темп эволюции неравномерен и зависит от внешних условий.

Жираф и вестибулярный аппарат: пример, который часто цитируют неправильно

Превращение предка жирафа в жирафа — один из любимых примеров тех, кто сомневается в дарвиновском механизме. Аргумент звучит так: удлинение шеи — это не только шея. Это вестибулярный аппарат, который должен компенсировать резкие подъёмы головы с земли на высоту шести метров. Это сердце, вынужденное качать кровь вверх на эту высоту: у жирафа самое большое сердце относительно тела среди наземных млекопитающих, весит около 11–12 килограммов и создаёт давление вдвое выше человеческого. Это клапаны в сосудах шеи, которые предотвращают прилив крови к голове при наклоне. Как всё это могло возникнуть одновременно?

Ответ биологов состоит в следующем. Во-первых, временной масштаб — миллионы лет. Предки современного жирафа известны по ископаемым: окапи, ближайший живой родственник жирафа, обходится значительно более короткой шеей. Среди вымерших жирафид существовали формы с разной длиной шеи. Каждый шаг удлинения создавал небольшое преимущество в доступе к корму — и каждый шаг сопровождался сопутствующими адаптациями сердечно-сосудистой системы, которые тоже были постепенными. Во-вторых, эволюция не проектирует: она отбирает из того, что есть. Ни одно поколение жирафов не «решало задачу» перепроектирования кровообращения. Просто особи с чуть лучше скоординированными системами выживали чуть лучше.

Это не опровергает сложность задачи — она действительно велика. Это лишь показывает, что аргумент о «невозможности постепенного изменения» требует учитывать реальный временной масштаб и отсутствие цели в процессе.

Лесной интернет: кооперация вместо войны

В 1997 году канадский эколог Сюзанна Симар опубликовала в Nature исследование, показавшее, что деревья передают углерод через подземные сети микоризных грибов — грибов, живущих в симбиозе с корнями растений. Берёзы в эксперименте передавали углерод молодым елям, находившимся в тени и испытывавшим дефицит фотосинтеза. Передача шла в обратном направлении, когда условия менялись.

Это было неожиданно. Образ леса как арены непрерывной борьбы — каждое дерево тянет воду и свет у соседей — оказался неполным. Микоризные сети связывают деревья в единую метаболическую систему, через которую происходит перераспределение ресурсов. Симар назвала крупные старые деревья «деревьями-матерями» — не метафорически, а функционально: они являются узлами сети с наибольшим числом связей и наибольшим потоком веществ.

Дальнейшие исследования показали, что через микоризные сети передаются не только питательные вещества, но и химические сигналы. Дерево, подвергшееся нападению насекомых-вредителей, выделяет химические вещества, которые через сеть достигают соседних деревьев и запускают в них защитные реакции — выработку токсинов или горьких соединений — до того, как вредители до них добрались. Это не сознательная коммуникация, но это именно информационный обмен, функционально аналогичный иммунному сигналу.

Пресс-популяризаторы немедленно назвали это «лесным интернетом» — и термин прижился, хотя специалисты к нему относятся с осторожностью: он создаёт иллюзию намеренности там, где идёт биохимический процесс. Тем не менее открытие радикально изменило представление о том, что такое экосистема: не набор конкурирующих организмов, а система с элементами интеграции, в которой кооперация и конкуренция существуют одновременно.

Это не опровергает Дарвина — он никогда не утверждал, что конкуренция является единственным отношением между организмами. Симбиоз, мутуализм и паразитизм присутствуют в его концепции. Но соотношение кооперации и конкуренции в реальных экосистемах оказалось значительно сложнее той картины, которую рисовали популяризаторы XIX века.

Направленные мутации: что это такое на самом деле

Одно из утверждений, которые часто встречаются в дискуссиях об эволюции, — что мутации направлены, а не случайны. За этим стоит реальное научное открытие, которое, однако, интерпретируется по-разному.

В 1988 году Джон Кэрнс и его коллеги опубликовали эксперимент, в котором бактерии, помещённые в среду с единственным источником пищи — лактозой, — которую они не умели переваривать, приобретали способность переваривать лактозу с частотой, превышающей случайную. Это назвали «адаптивными мутациями» — и дискуссия об их природе не закончена до сих пор. Часть исследователей считает, что речь идёт об особых механизмах ДНК-репарации, которые в условиях стресса работают менее точно и генерируют изменчивость именно в тех генах, которые активны в данных условиях. Это не «намеренное» изменение, но это и не равномерно-случайное — это стресс-индуцированная изменчивость, сфокусированная на участках, релевантных для выживания.

Отдельная область — эпигенетика. Метилирование ДНК, модификации гистонов и другие механизмы позволяют изменять экспрессию генов без изменения самой последовательности нуклеотидов, и часть этих изменений наследуется. Это расширяет механизмы наследственной изменчивости за пределы случайных мутаций нуклеотидной последовательности. Современная «расширенная синтетическая теория эволюции» включает эти механизмы — хотя их роль в макроэволюции ещё обсуждается.

Это не «разумный замысел» в теологическом смысле. Это сложность биологических механизмов, которая не укладывается в простую формулу «случайная мутация плюс отбор». Жизнь оказалась значительно более изощрённой в управлении собственной изменчивостью, чем предполагала классическая генетика середины XX века.

Что наука признаёт открытым

Честная картина состоит в следующем. Эволюция как механизм изменения видов со временем подтверждена наблюдениями, ископаемыми записями и геномным анализом достаточно убедительно, чтобы считаться одной из самых надёжных теорий в биологии. Детали механизмов — темп изменений, роль горизонтального переноса генов, значение эпигенетики, механизм «скачков» — остаются предметом активных исследований.

Происхождение генетического кода — то есть вопрос о том, каким образом возникла первая система, способная хранить информацию и воспроизводить себя, — остаётся открытым. Это не противоречие эволюции: эволюция начинается там, где уже есть самовоспроизводящиеся системы. До этого момента — пробел. Гипотезы существуют, но экспериментально воспроизвести возникновение генетического кода из нуля пока не удалось.

Крик, проведший жизнь в работе с ДНК, в поздние годы склонялся к гипотезе «направленной панспермии» — идее о том, что жизнь на Земле была намеренно занесена из другого места во вселенной развитой цивилизацией. Это не религиозная позиция — это попытка выйти из тупика, перенеся нерешённую задачу в другое место и другое время. Сам Крик признавал, что это скорее ход мысли, чем теория: доказать её нельзя, опровергнуть — тоже.

Физик Пол Дэвис в книге «Пятая чудо» (1998) сформулировал суть проблемы чётко: жизнь выглядит так, как будто в ней закодирована информация. Откуда берётся информация — вопрос, на который физика и химия пока не дают ответа. Это не мистика. Это честное описание состояния знания.

Тупик как точка отсчёта

Наука устроена так, что нерешённые вопросы являются её рабочим материалом, а не свидетельством провала. Когда физики начала XX века обнаружили, что классическая механика не объясняет излучение чёрного тела, это привело к квантовой механике — не к отказу от физики. Когда геологи отвергли дрейф континентов, они в итоге получили тектонику плит. Тупик — это место, где нужно искать иной путь, а не возвращаться назад.

Происхождение жизни — один из нескольких фундаментальных вопросов, для которых у современной науки нет полного ответа. Другие — природа сознания, интерпретация квантовой механики, физика до Большого взрыва. Эти пробелы не указывают на то, что нужно искать ответ за пределами науки. Они указывают на то, что наука не закончена.

Уотсон и Крик открыли двойную спираль в 1953 году. Геном человека был полностью секвенирован в 2003-м — пятьдесят лет спустя. Полное понимание того, как закодированная в нём информация управляет развитием организма, остаётся задачей на будущее. Это не поражение молекулярной биологии. Это её нормальный рабочий день.

«Нет» Крика на вопрос о случайном происхождении генетического кода — это не конец разговора. Это его начало.