Французский стартап Amatera утверждает, что высокопроизводительный скрининг новых сортов на стадии культивирования растительных клеток с привлечением ИИ является будущим селекции.
Французский стартап Amatera, использующий клеточные культуры растений, робототехнику и искусственный интеллект для ускорения разработки климатоустойчивых многолетних культур, завершил посевной раунд финансирования в размере 6 миллионов евро (7 миллионов долларов), пишет Элейн Уотсон в статье агропортала AgFunderNews.
Этот раунд финансирования, возглавляемый совместно компаниями Demea Sustainable Investment и Oyster Bay, а также существующими акционерами PINC, Mudcake и Exceptional Ventures, поможет фирме масштабировать свою селекционную платформу и выйти за рамки выращивания кофе и винограда.
«Создание нового сорта кофе или винограда с использованием традиционных методов селекции может занять более 20 лет и обойтись в миллионы евро. Мы ускоряем селекцию многолетних культур, чтобы создавать новые сорта за гораздо меньшие затраты и в меньшие сроки», — говорит соучредитель Омар Деккиче.
Компания Amatera утверждает, что создание и отбор новых сортов растений требует времени и денег, и считает, что сможет значительно сэкономить и то, и другое за счет высокопроизводительного скрининга новых сортов на стадии культивирования растительных клеток.
Amatera, основанная в 2022 году Омаром Деккиче и доктором философии Люси Кригсхаузер, первоначально специализировалась на разработке новых сортов многолетних сельскохозяйственных культур собственными силами путем индукции спонтанной генетической изменчивости с использованием физических и химических методов.
Этот ускоренный процесс естественной эволюции создает обширную библиотеку клеточных линий, не содержащих ГМО, которые секвенируются и анализируются для выявления тех, которые обладают желаемыми характеристиками. Перспективные кандидаты затем могут быть регенерированы в целые растения, которые можно тестировать в питомнике и в полевых условиях.
«Сегодня стандартный подход заключается в том, чтобы взять эти клетки, превратить их в растения, а затем провести генотипирование, чтобы увидеть, что получилось. Мы полностью меняем этот подход, изолируя все клетки друг от друга, выращивая их в культуре растительных клеток в лабораторных условиях, а затем идентифицируя интересующие нас клеточные линии и регенерируя в растения только их. Это позволяет сэкономить массу денег и времени. Вместо того чтобы регенерировать все клетки в растения, а затем проводить их скрининг, мы устранили узкое место, связанное со скринингом», — говорит Деккиче в интервью AgFunderNews.
По его словам, тот же высокопроизводительный автоматизированный скрининг можно применять и к клеточным линиям, созданным другими методами, такими как редактирование генов.
На вопрос о том, насколько скрининг на клеточной стадии может предсказывать продуктивность всего растения, он ответил: «Мы используем скрининг на клеточной стадии, когда у нас есть генетические маркеры, которые позволяют предсказать продуктивность всего растения. Мы отбираем клеточные линии на основе их генотипов. И хотя клетка в культуре не фотосинтезирует, не взаимодействует с почвенными микробами и не испытывает тех же стрессов, что и растение, существуют некоторые генетические маркеры/гены, которые, как было показано, влияют на фенотип. В случае с кофейными деревьями, например, большинство генов, участвующих в синтезе кофеина, известны, поэтому, создавая генетическую изменчивость в этих генах, вы будете модулировать уровень кофеина в растениях».
Что касается многолетних культур, Amatera разрабатывает и тестирует свои сорта собственными силами и планирует предоставлять лицензии на них другим компаниям. Что касается однолетних культур, Деккиче говорит: «Мы предлагаем технологическую платформу, чтобы они могли интегрировать наши технологии в свою производственную практику. Мы начали с кофейного дерева, затем добились успеха в селекции винограда, поэтому заключили партнерское соглашение в этой области, и тогда семенные компании, занимающиеся однолетними пропашными культурами и овощами, заинтересовались нашей технологией».
По винограду и кофейным деревьям в настоящее время в питомниках находятся перспективные кандидаты, отобранные в ходе скрининга в культуре растительных клеток. К ним относятся сорт кофе «Робустика», сочетающий в себе устойчивость робусты и вкус арабики, а также сорт арабики без кофеина. Также продвигается работа над сортами винограда, устойчивыми к ложной мучнистой росе и черной гнили. «Нам еще предстоит кое-что доработать, но мы уже добились значительного прогресса», отметил Деккиче.
В отношении однолетних культур компания надеется заключить в этом году несколько партнерских соглашений.
Источник: AgFunderNews. Автор: Элейн Уотсон. Фото: Amatera.
Интересна тема? Подпишитесь на наши новости в ДЗЕН | Канал в Telegram | Группа Вконтакте | Канал в MAX | Дзен.новости.