Почвенная биота — это комплекс разнообразных почвенных организмов, основной частью которой являются микроорганизмы (бактерии, грибы, водоросли) а также простейшие животные организмы, например черви.
Их количество в 1 г хорошо окультуренной почвы может исчисляться миллиардами, а общая масса в 1 гектаре может достигать до 10 т.
Почвенная биота принимает активное участи в формировании почвенного плодородия: минерализации органических веществ: растительных остатков, животных, органических удобрений. Дело в том, что органические соединения не являются питанием для растений, но зато являются хорошим питанием для почвенной биоты. И после переработки органики почвенной биотой одна часть органического вещества минерализуется полностью, а другая — переходит в форму гумусовых веществ и живых тел почвенных организмов. После минерализации органических соединений элементы питания с почвенным раствором поглощаются корневой системой растения.
Существуют клубеньковые бактерии, которые усваивают азот и