Со времени присоединения к России до середины 80-х гг. 19 века дальневосточные территории входили в состав Восточно-Сибирского генерал-губернаторства. Идея их административного обособления была выдвинута еще в 1860 г. графом Н.Н. Муравьевым-Амурским.
Но только через четверть века на административной карте России появилось Приамурское генерал-губернаторство — оно было образовано 28 июня 1884 г. В его состав были включены Забайкальская, Амурская и Приморская области, Владивостокское военное губернаторство, а также остров Сахалин. И именно с момента образования новой административной единицы началось стремительное развитие Хабаровска, который стал центром Приамурского генерал-губернаторства.
Айгунский и Пекинский договоры
Приамурские земли, открытые русскими землепроходцами в XVII веке, были воссоединены с Россией в 1850-е годы, во многом благодаря личной инициативе генерал-губернатора Восточной Сибири Николая Николаевича Муравьева-Амурского. Юридическое оформление этого факта связано с заключением Айгунского (1858) и Пекинского (1860) договоров между Россией и Китаем. Эти события стали большой победой русской дипломатии, сумевшей без единого выстрела значительно расширить границы Российского государства.
Согласно Айгунскому договору юридически устанавливалась принадлежность России левого берега р. Амура от р. Аргуни до устья, правый берег р. Амура до р. Уссури закреплялся за Китаем. Район между Уссури и морем объявлялся общим владением России и Китая. Плавание по Амуру, Сунгари и Уссури разрешалось только русским и китайским судам. Разрешалась взаимная торговля русского и китайского населения, проживающего по этим рекам.
В соответствии с Пекинским договором восточная граница между Россией и Китаем устанавливалась, начиная от слияния рек Шилка и Аргунь, вниз по течению р. Амур до места впадения в неё р. Уссури. Земли, лежащие по левому берегу (на север) Амура, объявлялись принадлежащими России, а по правому берегу (на юг) — Китаю. Далее граница устанавливалась по рекам Уссури и Сунгача, оз. Ханка, р. Беленхэ (Тур) и далее по горному хребту к устью р. Хубиту (Хубту, Ушагоу). Причём земли, лежащие к востоку от этой линии, объявлялись территорией России, а к западу от неё — территорией Китая. К договору была приложена карта восточного участка русско-китайской границы. Таким образом, Россия окончательно закрепила за собой Уссурийский край.
Была закреплена также и западная граница между двумя странами, она должна была проходить по ясно выраженным естественным ориентирам и «линии ныне существующих китайских пикетов», от перевала Шабин-дабага в Саянском хребте до Кокандских владений. Предусматривалось, что для разграничения восточных и западных участков русско-китайской границы будут назначены доверенные лица (комиссары).
Договор подробно регламентировал русско-китайские торговые отношения. На протяжении всей граничной линии дозволялась свободная и беспошлинная торговля между подданными обоих государств. Устанавливалось, что «русские купцы в Китае, а китайские в России состоят под особым покровительством обоих правительств». Русскому правительству разрешалось открыть свои консульства в Урге и Кашгаре. Китайское правительство, равным образом, могло назначить своих консулов в столицах и других городах Российской империи.
Основание Приамурского генерал-губернаторства
В 1860 году Н.Н. Муравьев-Амурский предложил выделить Приморскую область в отдельное генерал-губернаторство. Идея не нашла одобрения среди целого ряда министров, опасавшихся новых значительных расходов. Вплоть до начала 1880 годов проблема выделения Приамурья в отдельное генерал-губернаторство так и не была решена.
В 1883 году особым совещанием под руководством генерал-адъютанта Э.Г. Баранова было принято решение о необходимости разделения Восточной Сибири на два генерал-губернаторства: Иркутское и Приамурское. В состав второго предполагалось включение Забайкальской, Приморской и Амурской областей.
В состав Приамурского генерал-губернаторства вошли значительные территории: Чукотка, Камчатка, Охотское побережье, остров Сахалин, Приамурье, Приморье и Забайкалье.
Административным центром нового края стала Хабаровка, основанная в 1858 году как поселение 13-го Восточно-Сибирского линейного батальона и названная в честь землепроходца Ерофея Павловича Хабарова. Как отмечалось в одном из справочных изданий того времени, "Город Хабаровка отличается своим выгодным местоположением, обещающим ему прочную будущность при дальнейшем развитии Амурского края".
В 1893 г. административный центр Приамурского генерал-губернаторства Хабаровка был переименован в город Хабаровск.