Для выявления внутриклеточных включений в качестве флюорохрома применяют акридиновый оранжевый в разведении 1 : 20 000-1 : 30 000. Для флюорохромирования препараты готовят таким же образом, как и для обычной окраски. Можно использовать препараты нативные и фиксированные в ацетоне в течение 10-15 мин. Метод флюорохромирования и микроскопии препаратов не отличается от применяемого в бактериологии.
В препаратах, флюорохромированных акридиновым оранжевым, включения, содержащие дезоксирибонуклеиновую кислоту, дают голубовато-зеленое свечение, демонстративно выделяясь на сероватом фоне цитоплазмы, а включения, содержащие рибонуклеиновую кислоту, - красновато-оранжевое.
Выявление внутриклеточных вирусных включений при большинстве инфекций, как и вирусоскопия, является ориентировочным методом быстрой лабораторной диагностики заболевания, и только при некоторых инфекциях обнаружение включений имеет диагностическое значение.