Ученые разработали новый биоинформатический метод, который позволяет выявлять полезные бактерии, способные бороться с возбудителем опасной кишечной инфекции — Clostridioides difficile .
Как это работает?
Проблема возникает часто после приема антибиотиков, когда баланс микрофлоры нарушается, и C. difficile выходит из-под контроля. Исследователи обнаружили, что некоторые полезные микробы могут не атаковать вредителя напрямую, а просто быстрее потреблять те аминокислоты, которые жизненно необходимы C. difficile для роста. Фактически, они «съедают его обед», лишая пищи и не давая размножаться .
В чем прорыв?
Ученые построили специальный алгоритм, который анализирует геномы тысяч микроорганизмов и предсказывает, какие из них являются самыми эффективными «конкурентами» за ресурсы против C. difficile. Это открывает путь к созданию новых, целенаправленно подобранных пробиотиков для борьбы с инфекцией, что является более естественным подходом, чем повторный курс антибиотиков .