В 1989 году наступили экономически тяжелые времена. В результате родителям учеников школы сообщили о переводе ее в восьмилетнюю, поскольку комиссия посчитала содержание старшеклассников в количестве 10-15 человек экономически нецелесообразным. Коллектив учителей и местные жители восприняли это как оскорбление. Общественность настойчиво отстаивала права детей на получение среднего образования в школе, где они начали учиться в первом классе, и только спустя несколько месяцев их активных действий удалось добиться сохранения учебного заведения в прежнем статусе.
В 1990-е годы директором школы был Николай Фёдорович Глухих. В эти годы учащиеся старших классов, которые увлекались гуманитарными дисциплинами, создали историко-патриотическое объединение под названием «Хронос». Руководителем этого объединения стала Марина Аркадьевна Глухих.
В декабре 1991 года в музее, посвящённом родственникам жертв репрессий, было принято решение создать мемориал в память о репрессированных жителях Тайги. Дл