Алекс Маркес вновь показал лучший результат, заняв первое место во второй практике MotoGP в Портимао. Пилот установил время 1:37.974, удержав лидерство под давлением со стороны Педро Акосты и Франческо Баньяи. Франко Морбиделли и Лука Марини упали в начале сессии, нарушив первые попытки ряда гонщиков. Жоанн Зарко столкнулся с технической проблемой в первые 20 минут практики, что стало непростым началом для команды «Honda», которая ранее демонстрировала неплохие результаты. Когда над трассой появились красно-белые флаги, предупреждающие о дожде, Джек Миллер упал на пятом повороте, после чего несколько гонщиков вернулись в боксы. Педро Акоста остался на трассе и сумел улучшить время, но не смог догнать Маркеса в заключительном секторе.
Однако на следующем круге Акоста показал результат, позволивший временно сместить Маркеса с вершины таблицы. Вдохновлённый ускорением соперника, Алекс Маркес немедленно вернулся на трассу и вновь вышел вперёд — преимущество пилота «Gresini» в последнем сек