Учитывая, что рисом питается половина населения мира, задача создания новых сортов, устойчивых к изменению климата, вредителям и болезням, а также растущему спросу, остаётся актуальной и требует больших затрат времени. Для решения этой проблемы Enterprise Breeding System (EBS) внедрила на своей глобальной платформе новую функцию под названием QTL Profiling.
Профилирование QTL позволяет селекционерам точно определить, какие гены и признаки присутствуют или отсутствуют в их селекционном материале. Этот новый инструмент, разработанный благодаря техническому опыту учёного IRRI доктора Дэмиена Платтена, сокращает недели работы до минут, быстро определяя такие признаки, как устойчивость к болезням, засухоустойчивость или качество зерна в геноме растения. Это, в свою очередь, помогает ускорить разработку сортов риса, способных удовлетворить растущий спрос и адаптироваться к последствиям изменения климата.
Традиционно анализ молекулярных данных был медленной и кропотливой задачей, которая часто занимала дни, а то и недели, включая очистку наборов данных и интерпретацию результатов. Благодаря новому инструменту, встроенному в модуль анализа молекулярных данных (MDA) на платформе EBS, процесс упрощается до трёх этапов: запрос, загрузка и анализ. За считанные минуты селекционеры получают точные профили QTL, что позволяет им сосредоточиться на принятии стратегических решений в селекции.
Для риса, где IRRI лидирует в мировой селекции, инструмент генерирует профили QTL примерно для 90 высокоценных генов, контролирующих признаки, наиболее востребованные фермерами и потребителями. Он даёт селекционерам «мгновенную картину» того, несут ли их линии критически важные признаки, обеспечивающие устойчивость риса к изменению климата, что упрощает им выбор сортов для сохранения, скрещивания или выпуска в производство, и, следовательно, сокращает время, необходимое для выращивания улучшенных семян.
Обновление также поддерживает проверку качества семян, подтверждение происхождения и анализ признаков риса и других культур. Функция QTL-профилирования очищает данные ДНК, идентифицирует ключевые маркеры, сравнивает гены разных сортов и представляет визуализированные результаты, что упрощает выбор лучших сортов для селекции.
«Эта новая возможность EBS для обработки генетической информации и данных ДНК знаменует собой важную веху в нашей миссии по упрощению работы селекционеров, одновременно предоставляя им возможность оказывать большее влияние на фермеров», — сказал Андре Моретто Эмберсикс, руководитель отдела цифровых решений по селекционным ресурсам CGIAR.
«Это достижение стало возможным только благодаря самоотверженности команды BR Digital Solutions и прочным партнёрским отношениям, которые мы выстроили с центрами CGIAR, такими как IRRI. Команда IRRI Rice была нашим надёжным партнёром ещё до того, как EBS появился на рынке, и сотрудничество с ними продолжает приносить значимые результаты», — добавил он.
О платформе EBS
Система селекционной работы (EBS) – это глобальная цифровая платформа CGIAR, разработанная для поддержки современной селекции растений. Благодаря интеграции инструментов управления данными, аналитики и поддержки принятия решений, EBS позволяет селекционерам по всему миру эффективнее и продуктивнее создавать улучшенные, устойчивые к изменению климата и востребованные рынком сорта сельскохозяйственных культур. Рис, пшеница и кукуруза стали одними из первых, где внедрили EBS, и теперь платформа поддерживает 20 культур в центрах CGIAR и NARES.
Это обновление также вносит вклад в работу IRRI в рамках научной программы CGIAR «Селекция для будущего» (B4T) в рамках направления «Инклюзивная поставка». Программа направлена на повышение производительности, более широкое внедрение сортов и поддержку более устойчивых и ориентированных на фермеров продовольственных систем путем внедрения рыночной аналитики в селекционные процессы в Африке и Азии.
Источник: IRRI.
Интересна тема? Подпишитесь на наши новости в ДЗЕН | Канал в Telegram | Группа Вконтакте | Дзен.новости.