Исследование микробиоты будет играть значительную роль в клиниках в течение ближайших 5–10 лет

Диагностическое и терапевтическое использование микробиоты станет реальностью в ближайшие 5-10 лет.

Об этом говорится в обзорной статье, опубликованной в журнале Cell и написанной врачами для врачей, чтобы проинформировать клиницистов о том, что ряд ценных диагностических и терапевтических применений на основе микробиома может быть не за горами, и преодолеть коммуникационный разрыв между фундаментальными исследователями и клиницистами, который замедляет их внедрение. Гастроэнтеролог Джанлука Ианиро из Католического университета (Италия) объясняет: "Мы решили, что пришло время проанализировать возможные клинические применения микробиома. Несмотря на огромное количество исследований микробиома, клинических применений пока очень мало, иногда они не совсем ортодоксальны, иногда «примитивны». Но скоро ситуация изменится, ведь микробиом - идеальная мишень для прецизионной медицины, он специфичен для каждого человека и меняется по составу в зависимости от жизненных событий и диеты".

Так почему же он до сих пор не применяется в клинической практике? "Из-за целого ряда проблем", - объясняет Ианиро. Первая - биологическая: трудно выявить причинно-следственные связи между составом микробиома и заболеваниями из-за гетерогенности и сложности кишечного микробиома. Вторая - методологическая: клинические исследования микробиома сложны, поскольку при их проведении необходимо учитывать диету, принимаемые лекарства и влияние окружающей среды; кроме того, отсутствуют стандартизированные протоколы для его анализа. Третья - логистическая: не хватает крупномасштабных многоцентровых исследований, поскольку большинство доказательств в этой области получено в результате академических исследований, проводимых отдельными центрами с небольшим объемом выборки (финансирование также ограничено). Между клиницистами и фундаментальными учеными практически нет связи. Последнее «препятствие» - культурное: ограниченное знакомство большинства врачей с микробиомом мешает клиническому применению данных исследований.

Тем не менее, полученные на сегодняшний день результаты свидетельствуют о перспективах как диагностического, так и терапевтического использования микробиоты в ближайшие 5-10 лет (особенно в диагностической сфере). Ианиро объясняет: "В первом случае микробиота может быть использована в качестве биомаркера раннего заболевания; в этой области наиболее убедительными на сегодняшний день являются исследования рака толстой кишки. Микробиота может использоваться как предиктор ответа на терапию (например, иммунотерапия в онкологии), или для дифференциальной диагностики между язвенным колитом и болезнью Крона. С терапевтической стороны у нас есть несколько направлений. Одно из них - фекальная трансплантация, которая становится все более совершенной и переходит к микробным консорциумам (своего рода коктейль из отобранных микробов, который уже используется для лечения колита, вызванного Clostridium difficile). Другая многообещающая перспектива - бактериофаги, которые колонизируют патогенные бактерии и уничтожают их («литические» фаги); и, наконец, инженерия пробиотиков (производителей или носителей полезных соединений)".

«Мы ускоряем использование микробиома в клинической практике с помощью различных возможных действий. Стандартизируя исследования и отчетность по анализам микробиоты от одной лаборатории к другой; улучшая дизайн клинических испытаний; уточняя обоснование испытаний (понимание механизмов посредством фундаментальных исследований и построения клинических испытаний, основанных на результатах этих исследований); соединяя мир исследований с миром клиницистов, обеспечивая обучение и продвигая междисциплинарность. Первым в клиниках появится скрининговый тест на рак толстой кишки, который поможет определить показания к колоноскопии для людей, у которых, помимо положительного анализа кала на скрытую кровь, имеется определенный тип микробиоты», - рассказал Ианиро.

На горизонте появляется еще один тест, позволяющий предсказать ответ на иммунотерапию у онкологических больных (наиболее убедительные данные на данный момент получены по раку легких и меланоме). Что касается терапии, то в дополнение к установленным показаниям для трансплантации микробиоты при колите, обусловленным Clostridium difficile, следующие применения будут направлены на уничтожение бактерий с множественной лекарственной резистентностью, таких как Klebsiella, при кишечных инфекциях или до того, как они нанесут ущерб (например, у пациентов, ожидающих трансплантации органов). Таким образом, следующим рубежом станет использование микробиоты для усиления действия иммунотерапии в онкологии.