Сотрудники лаборатории ДНК маркеров растений ВНИИ сельскохозяйственной биотехнологии провели исследование трехлетней динамики популяции оомицета Phytophthora infestans (фитофтора) в Московской области. Анализировался полиморфизм 12 SSR локусов, и полученные результаты молекулярных исследований были сопоставлены с данными о устойчивости к фунгицидам и вирулентности изучаемых генотипов.
В результате исследования было установлено, что в отличие от европейских популяций, популяция P. infestans в Московской области демонстрирует ежегодные изменения в составе доминирующих генотипов. При этом в ней не встречаются широко распространенные в Западной Европе высокоагрессивные клональные линии. Эти результаты были опубликованы в журнале «Plant Pathology».
Фитофтороз, вызываемый оомицетом Phytophthora infestans, представляет собой одно из наиболее значимых заболеваний картофеля.
Увеличившийся эпидемиологический потенциал P. infestans привел к значительному снижению эффективности ранее применяемых методов защиты картофеля, включая культивирование устойчивых сортов, а также биологические и химические методы защиты.
Для генотипирования P. infestans обычно применяется набор из 12 маркеров простых последовательных повторов (SSR), который позволяет проводить сравнение популяций патогенов, собранных в различных регионах мира.
Целью данного исследования было исследование полиморфизма P. infestans с использованием 12 маркеров SSR на одном участке в течение трех лет, а также сравнение результатов молекулярного анализа с фенотипическими характеристиками, такими как тип спаривания, устойчивость к металаксилу и вирулентность.
Исследователи ВНИИСБ провели анализ 55 изолятов P. infestans, собранных с различных сортов картофеля и межвидовых гибридов в полевых условиях в период с 2018 по 2020 год.
В ходе работы были получены данные о полиморфизме популяций, определены доминирующие клональные линии, а также установлено, что популяции в Московской области демонстрируют высокий уровень полиморфизма, при этом доминирующая клональная линия P. infestans изменяется ежегодно. Сравнительный анализ этих результатов с данными других исследователей показал значительные различия в SSR-профилях генотипов P. infestans, выявленных на европейской части России и в Европе.
Источник и фото: ВНИИСБ в социальной сети ВК.
Интересна тема? Подпишитесь на наши новости в ДЗЕН | Канал в Telegram | Группа Вконтакте | Дзен.новости.