Ученые Института персонализированной онкологии Первого МГМУ имени И. М. Сеченова работают над созданием мультиомиксной онкодиагностической платформы нового поколения «Онкофьюжн», включающей в себя программное обеспечение и набор реагентов для лабораторной диагностики. С ее помощью можно будет определять геномные перестройки в опухоли в одном тесте, используя при этом минимальное количество опухолевого материала. Полученные данные помогут врачам подбирать пациентам с наиболее агрессивными злокачественными новообразованиями максимально эффективное персонализированное лечение. Над созданием платформы ученые Сеченовского Университета работают совместно с индустриальным партнером компанией «Онкобокс» – ведущим разработчиком в области молекулярной биологии и персонализированной медицины.
Разрабатываемая онкодиагностическая платформа позволяет выявлять в опухолевых образцах так называемые химерные онкогены, возникающие из-за геномных перестроек в опухоли. Такие гибриды образуются путем слияния двух исходных генов. Некоторые из химерных генов провоцируют активный рост опухоли, и против них уже созданы молекулярно-нацеленные лекарства. В солидных (плотных) опухолях химерные онкогены образуются, например, с участием генов ALK, NTRK, MET, RET, ROS1 и других.
Сейчас для их обнаружения применяют методы иммуногистохимии, флуоресцентной гибридизации, полимеразной цепной реакции и другие техники. Но каждая из них имеет свои ограничения: низкую чувствительность и неспособность отличать значимые мутации от случайных. Отличительная особенность подхода ученых Сеченовского Университета – определение всех геномных перестроек в одном тесте. Для этого они будут использовать метод направленного секвенирования РНК.
«Наша онкодиагностическая платформа будет выявлять перестройки генов ALK, FGFR, MET, NTRK, RET, ROS1, – рассказал руководитель проекта, главный научный сотрудник Института персонализированной онкологии Первого МГМУ профессор РАН Антон Буздин. – Такие перестройки встречаются практически во всех типах опухолей, хотя и крайне редко. Их своевременная детекция очень важна, поскольку при наличии таких перестроек опухоль особенно агрессивна. При этом для каждой из них уже разработаны специфические противоопухолевые препараты. Их применение в таких случаях часто дает «эффект Лазаря», когда заболевание полностью или почти полностью отступает, даже на поздних стадиях».
Уникальность платформы «Онкофьюжн» в том, что все онкогенные перестройки можно будет определять в одном тесте, используя при этом минимальное количество опухолевого материала. Это очень важное преимущество, поскольку объем материала может быть сильно ограничен и необходимо, чтобы его хватило на все необходимые исследования. Кроме того, разработчики поставили перед собой задачу сделать создаваемую технологию максимально доступной для пациентов – тогда ее смогут использовать большее количество людей с онкозаболеваниями.
На сегодняшний день уже создан общий экспериментальный дизайн платформы и детально проработана технология выявления нескольких из заявленных генов. Разработку прототипа платформы планируется завершить в 2026 году. Проект реализуется в рамках программы стратегического академического лидерства «Приоритет-2030».
Если Вам понравилась статья, просим поставить лайк и подписаться. Еще больше интересных и полезных статей вы можете прочитать - в нашем канале в Телеграм, и на сайте издательства "МЕДИК" medik.press. Будьте здоровы!
Источник: ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет)