Генетики прочитали ДНК трех десятков бонобо и выяснили, что эволюционные линии предков обыкновенных и карликовых шимпанзе разошлись около 1,3 миллиона лет назад. Спустя примерно миллион лет, около 145 тысяч лет назад, популяция бонобо разделилась на центральную и западную субпопуляции, а еще приблизительно через 85 тысяч лет последняя разделилась на две. Причем эффективный размер одной из западных субпопуляций, по оценкам ученых, на протяжении долгого времени составлял всего лишь 2,8 тысячи особей, что заметно сказалось на их генофонде и сделало их потенциально еще более уязвимыми перед различными угрозами. Об этом сообщается в статье, опубликованной в журнале Current Biology.
В тропических лесах Центральной Африки обитает один из двух ближайших к человеку видов приматов — бонобо (Pan paniscus), которых также часто называют карликовыми шимпанзе. Бонобо — редкие вымирающие обезьяны, количество которых в дикой природе оценивается примерно в 20 тысяч особей. Причем ареал этого вида находится на территории политически нестабильной Демократической Республики Конго, что осложняет его охрану и исследования.
Генетические исследования подтвердили, что обыкновенные шимпанзе (P. troglodytes) и бонобо ближайшие родственники Homo. По последним оценкам, эволюционные линии этих двух родов разделились примерно 6,3–5,5 миллиона лет назад (хотя, возможно, даже раньше — около 8–7 миллионов лет назад). Внутри рода Pan пути предков обыкновенных и карликовых шимпанзе разошлись в период между 2 и 0,9 миллиона лет назад, когда предки одного из этих видов переправились через реку Конго и оказались в естественной изоляции.
Хан Со Чжун (Sojung Han) из Университета Пумпеу Фабра совместно с коллегами из Австрии, Германии, Дании, Израиля и Испании представила результаты дальнейших исследований генофонда бонобо. Для этого ученые прочитали ДНК 20 диких особей, а также 10 бонобо, которые содержатся в европейских зоопарках, но родились в дикой природе. Кроме того, в своей работе они использовали 20 ранее опубликованных геномов обыкновенных шимпанзе и 20 человек из Западной Африки, которые относят себя к народам йоруба.
Генетический анализ показал, что популяция бонобо делится как минимум на три субпопуляции, которые занимают определенную часть ареала. Так, они выделили центральную субпопуляцию и две западных (одну из них ученые называют дальнезападной). По словам ученых, возможно, существует и восточная субпопуляция, однако геномы ее представителей не попали в проанализированную выборку, но это предстоит подтвердить или опровергнуть в будущем.
По расчетам исследователей, эволюционные линии обыкновенных и карликовых шимпанзе разделились примерно 1,29 миллиона лет назад (1,21–1,37 миллиона лет назад при доверительном интервале (ДИ) 95 процентов). Около 145 тысяч лет назад (302–116 тысяч лет назад при ДИ 95 процентов) разошлись пути предков бонобо из центральной и западной субпопуляции, а примерно 60 тысяч лет назад (116–23 тысячи лет назад при ДИ 95 процентов) западная субпопуляция разделилась на две: западную и дальнезападную.
История трех субпопуляций, выявленных исследователями, отличалась друг от друга, в результате чего генетическое разнообразие особей из центральной субпопуляции оказалось выше примерно в 1,4 раза, чем у представителей дальнезападной субпопуляции. По-видимому, на протяжении длительного периода времени ее эффективный размер был заметно ниже. По оценкам ученых, он составлял 2840 особей (1600–4010 при ДИ 95 процентов). В то же время в западной субпопуляции этот показатель достигал 4550 особей (1600–7220 при ДИ 95 процентов), а в центральной — 6840 особей (4810–8020 при ДИ 95 процентов).
Низкий эффективный размер дальнезападной субпопуляции создает дополнительные риски вымирания этих бонобо. Скрещивание близкородственных особей ведет к тому, что в их генофонде накапливается большой количество вредных мутаций, а также повышается гомозиготность. Так, в геномах особей из дальнезападной субпопуляции присутствуют длинные сегменты гомозиготности, которые в среднем больше, чем у представителей центральной и западной субпопуляций, на 29 процентов. По сравнению же с людьми они длиннее в среднем на 61 процент, а с обыкновенными шимпанзе — на 139 процентов.
Долгое время предполагалось, что бонобо гораздо менее агрессивны, чем обыкновенные шимпанзе. Однако недавно зоологи выяснили, что в действительности самцы бонобо не так миролюбивы, как считалось.