Новый метод микроскопии позволяет ученым получить изображение того, как белки и хромосомы взаимодействуют в интактной клетке.
Исследователи выстраиваются в очередь, чтобы опробовать мощный метод микроскопии, который позволяет одновременно секвенировать ДНК отдельной клетки и определять расположение ее белков с высоким разрешением - и все это без необходимости вскрывать клетку и извлекать ее содержимое. Изображение ДНК и белков внутри неповрежденных клеток дает важнейшую информацию о том, как эти молекулы работают вместе. Разработчики метода уже использовали его для изучения того, как старение может изменить способ взаимодействия в ядре белков с хромосомами. Они обнаружили, что по мере старения организма изменения в этих ядерных белках могут подавлять активность генов.
«Эта работа действительно необычна», - говорит Анкур Шарма, биолог-онколог из Института медицинских исследований Гарвана в Сиднее (Австралия), который не принимал участия в исследовании, но очень хочет использовать этот подход для изучения раковых клеток и назвал его „феноменальным“. Метод, названный расширенным геномным секвенированием in situ, был описан в препринте, опубликованном на сайте bioRxiv 26 сентября. Он еще не прошел рецензирование.
Этот метод может оказаться особенно полезным для исследователей, изучающих как ДНК обматывается вокруг белков и укладывается в ядра клеток, и как расположение генов в этой массе может влиять на их активность. "Мы можем думать о ДНК как о «линейной строке информации, которую нужно сжать и организовать внутри клеточного ядра размером 5 микрон», - говорит Джейсон Буэнростро, генетик из Гарвардского университета и один из авторов препринта. «Но в том, как именно происходит это складывание, есть много информации».
Чтобы извлечь эту информацию, Буэнростро и его коллеги объединили два ранее описанных метода. В одном из них клетка получает специальный фермент для копирования ДНК, а также набор флуоресцентно меченых компонентов ДНК, которые должны быть включены в растущие нити ДНК один за другим. Считывая последовательность добавления флуоресцентных меток, исследователи могут определить последовательность фрагментов генома.
Источник: Nature news, 10 Oct.,2024
