В 1775 г. началась губернская реформа Екатерины II. В соответствии с «Учреждением об управлении губерниями», страна делилась на 40 губерний, каждая губерния – на уезды (от 6 до 15). В связи с этим, в каждой губернии устраивалась губернская, а в каждом уезде – уездная тюрьма. В Казани в этот период была построена губернская, а затем учреждена и пересыльная тюрьма, а также здания Казанских арестантских рот гражданского ведомства.
«Здание под Кремлем» (ныне ул. Батурина, 7, бывшая Односторонняя пересыльного замка) было построено казанским купцом Иваном Михляевым (1667-1728) в начале ХVIII в. для суконного производства, которое в 1722 г. посетил Петр I. После смерти Михляева его состояние перешло в собственность родственников жены – Дрябловых, после которых суконными фабриками владело купеческое семейство Осокиных. В конце XVIII в. производственное здание у Кремля было передано ими на нужды города. Оно было расширено и переоборудовано в пересыльную тюрьму.
В результате реконструкции здание преобразовали в комплекс, который состоял из трех- и двухэтажного корпусов, объединенных между собой таким образом, что возник замкнутый прямоугольный двор, вытянутый с севера на юг. С северной стороны для въезда во двор был сделан арочный проезд с массивными двойными воротами. Пересыльная тюрьма стала каменной.
Ежегодно через тюрьму проходило более 5000 человек. Так, в 1875 г. поступило 4501 мужчин, 695 женщин, 937 детей. Арестанты в количестве одновременно до 800 человек (зимой – 350) размещались по камерам, которых не хватало, т.к. «в тюрьме по кубическому содержанию воздуха могут быть помещаемы не более как от 120 до 150 арестантов». Не имелось возможности размещать заключенных по категориям, за исключением того, что семейные отделялись от холостых арестантов. Связано это было с тем, что нередко за мужьями в Сибирь следовали их семьи.
В этом прискорбном заведении побывало немало известных осужденных людей. Так в 1827 г. в пересыльной тюрьме по дороге в сибирскую ссылку от нервной горячки скончался участник вооруженного восстания на Сенатской площади, декабрист А.Гриневицкий. В 1863 г. в казанской тюрьме содержались члены террористической организации «Земля и воля», а также участники революционных кружков. Томился в казанской тюрьме и знаменитый русский социолог, публицист и беллетрист, участник общественных движений 1860-1890-х гг. В. Берви-Флеровский (1829-1918).
В ночь с 4 на 5 декабря 1887 г. в пересыльную тюрьму под конвоем в числе 33 задержанных был доставлен В. Ульянов – один из активных организаторов и участников студенческой сходки 4 декабря в Казанском университете. Стены тюрьмы помнят также марксиста Н. Федосеева, организовавшего в Казани несколько тайных кружков по изучению трудов Карла Маркса. В июле 1889 г. Федосеева арестовали за нелегальную политическую деятельность, и он провел в одиночной камере 15 месяцев.
После Октябрьской революции Казанская пересыльная тюрьма продолжала использоваться по прямому назначению – для изоляции от общества нарушителей закона и неугодных властям «элементов». Среди известных арестантов пересыльной тюрьмы послереволюционного периода был Шакур Рахимов, более известный под именем Шакур Карак. Пересыльная тюрьма была местом содержания таких «политических узников», как Фатих Карим и Хасан Туфан.
В 60-х годах прошлого века тюрьма была перепрофилирована под онкологический центр. Постановлением Совета Министров РСФСР от 07.09.1976 № 493 здание по адресу ул. Батурина, 7 стало объектом культурного наследия федерального значения. Сегодня в отремонтированном здании помимо Института истории им.Ш.Марджани АН РТ, расположены общественные и муниципальные организации.