Действие фильма начинается во время Великой Отечественной войны. Молодого матроса Анатолия и его капитана захватывают немцы. В обмен на свою жизнь Анатолий соглашается застрелить капитана. После выстрела немцы оставляют его на заминированном корабле, но Анатолий чудом выживает.
Через годы он становится монахом в отдаленном монастыре на острове в северных регионах России. Анатолий живет как отшельник в котельной, ежедневно работая и молясь, страдая от чувства вины за убийство.
В монастыре Анатолий обретает репутацию святого человека, к нему приходят за советом и исцелением. Несмотря на признание со стороны других, он продолжает считать себя грешником и молится о прощении за убийство капитана.
Анатолий ведет себя необычно для монаха: он иногда странно шутит, ведет себя эксцентрично, что вызывает недоумение у братьев по монастырю. Однако его духовная сила и прозорливость неизменно притягивают людей.
В фильме показываются эпизоды, где Анатолий оказывает помощь людям, пророчествует и чудесным образом исцеляет больных, но сам он по-прежнему мучается чувством вины. Он верит, что грех убийства не позволяет ему быть по-настоящему святым.
В кульминации фильма на остров приезжает пожилой человек, который оказывается тем самым капитаном, которого Анатолий считал убитым. Оказывается, что капитан выжил. Это неожиданное событие приносит Анатолию огромное облегчение, так как он понимает, что его греха убийства не было.
Анатолий обретает покой, осознав, что Бог услышал его молитвы. Он умирает, приняв смерть как дар, с миром в душе.
Монахи, которые всегда считали его странным, начинают осознавать истинное величие духа Анатолия. Фильм заканчивается на философской ноте, подчеркивая темы прощения, смирения и духовного поиска.