Исследователи из Уппсальского университета (Uppsala University), используя уникальную коллекцию генетических и клинических данных о колоректальном раке, обнаружили новые генетические изменения и разработали новый молекулярный классификатор вариантов опухолей. Это открытие обещает улучшить возможности для индивидуальной терапии.
Уникальная коллекция данных о колоректальном раке
Колоректальный рак является третьим по распространённости и вторым по смертности типом опухолей. Заболевание вызывается мутациями в генах, которые приводят к неконтролируемому росту клеток. Понимание связи между генетическими изменениями, развитием и прогнозом заболевания является важным шагом в борьбе с этой опасной болезнью.
Исследователи из Уппсалы и их коллеги секвенировали ДНК из опухолевых и нормальных тканей более тысячи пациентов с колоректальным раком. Они также имели доступ к клинической информации об этих пациентах, что позволило создать одну из крупнейших в мире когорт колоректального рака с исчерпывающими клиническими и геномными данными.
«Объём этого набора данных является новаторским и предлагает большое количество информации для учёных в этой области», — говорит Тобиас Шёблом (Tobias Sjöblom), профессор кафедры иммунологии, генетики и патологии и один из исследователей, возглавлявших исследование.
В первой публикации группы исследователи идентифицировали почти сотню мутировавших генов, вызывающих рак. Из них девять были новыми для колоректального рака, а 24 — для любого рака. Исследователи также изучили, какие виды генетических изменений присутствовали, включая небольшие мутации и более крупные структурные вариации, а также изменения, влияющие на активность генов.
Полученную генетическую информацию сравнили с клинической информацией, особенно с данными о выживаемости. Это позволило определить ключевые прогностические геномные изменения в конкретных группах пациентов. Некоторые результаты подтвердили предыдущие исследования, в то время как другие были новыми открытиями.
Учёные также использовали результаты исследования для разработки новой стратегии молекулярной классификации колоректального рака. Их классификатор основан на активности генов и позволяет эффективно разделить большинство опухолей на пять прогностических подтипов с чёткими молекулярными особенностями. Это уточнение и дополнение предыдущих классификаторов подтипов колоректального рака обеспечивает более чёткую прогностическую картину различных групп опухолей.
Учёные считают, что открытие прогностических мутаций и новых молекулярных подтипов опухолей важно как для будущих исследований генов колоректального рака, так и для разработки инновационных диагностических и терапевтических стратегий. Они надеются, что их исследование приблизит нас к точной медицине с более эффективными методами лечения и улучшением результатов лечения пациентов.
Литература:
Tobias Sjöblom, Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers, Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-07769-3. www.nature.com/articles/s41586-024-07769-3