Чалая масть определяется доминантнымгеном Rn (от англ. roan — чалый), рецессивный аллель соответственно обозначается rn. Ген чалой масти относится к генам-модификаторам. Таким образом, у чалой лошади хотя бы один из родителей должен быть чалым.
Ген чалой масти действует «поверх» других неаллельных генов и превращает:
- вороную масть — в вороно-чалую
- гнедую масть — в гнедо-чалую
- рыжую масть — в рыже-чалую
- саврасую — в саврасо-чалую (внешне она похожа на светло-гнедо-чалую, только у такой лошади присутствуют «дикие» отметины)
- соловую — в солово-чалую
- и т. д.
Гипотеза летальности гена чалой масти
В 1979 г. ученые Хинц и Ван Влекк в Journal of Heredity опубликовали свою работу «Lethal Dominant Roan in Horses». В этой статье они выдвинули теорию, что гомозиготный набор гена чалости RnRn является летальным и такие эмбрионы гибнут в утробе матери. Упоминание об этой теории, в том числе как об истинной, до сих пор можно найти в иппологической литературе.
В начале XXI века Энн Т. Боулинг доказала, что эта теория с большой долей вероятности неверна, поскольку Хинц и Ван Влекк основывались только на исследовании родословных, не изучая причины смерти конкретных жеребят.
В 2009 году был разработан анализ на ген чалой масти, и ученые обнаружили в породах квотерхорс и американский пейнтхорс немало лошадей, гомозиготных по этому гену. Таким образом, спустя 30 лет после выхода труда Хинца и Ван Влекка ошибочность их гипотезы была доказана.