Осенью 1941 года гитлеровские войска начали решительное наступление на столицу СССР. К 16 октября Москва была взята в осаду, что привело к быстрой эвакуации государственных учреждений и организаций. Народный комиссариат внутренних дел (НКВД) был переведен в Куйбышев (ныне Самара), назначенный запасной столицей Советского Союза. В этот переезд попали не только имущество и сотрудники комиссариата, но и важные политические заключенные. Эти заключенные содержались в тюрьме НКВД на улице Садовый проезд, которая сейчас является Федеральным исправительным учреждением СИЗО № 1 Самарской области. В Куйбышеве НКВД действовал из комплекса на улицах Степана Разина и Пионерской, где сейчас находится новый комплекс ФСБ по Самарской области. Сотрудники спецслужб быстро начали готовить запасную столицу к приезду первых лиц государства, включая главу НКВД Берию и, возможно, самого Сталина.
Однако ни Сталин, ни Берия не переехали в запасную столицу. Вместо этого ключевых политических заключенных вывезл