Генетическую диагностику нового поколения запускают в Новосибирске

Новосибирск. 6 июня. ИНТЕРФАКС - Резидент "Сколково" и технопарка новосибирского Академгородка (Академпарка), инновационная компания "Национальный центр генетических исследований" (Новосибирск) планирует в течение 1,5 лет развернуть несколько проектов по диагностике на основе геномного секвенирования нового поколения (NGS), сообщил "Интерфаксу" руководитель отдела разработки компании Валерий Полуновский в четверг.

"Мы будем смотреть те маркеры, которые мы и так смотрим (традиционной ПЦР-диагностикой - ИФ), вторая история, которая планируется - это MODY-диабет, врожденная форма сахарного диабета, другие врожденные формы метаболических заболеваний", - сказал он.

Также предполагается разработать методику типирования туберкулеза, на основе результатов которого можно оценивать устойчивость возбудителя к антибиотикам, отметил Полуновский.

"Это (планируется сделать - ИФ) в ближайшие 1,5 года, требуется большая работа по сбору клинических образцов, верификации тест-систем и отладке", - добавил он.

По словам собеседника агентства, одной из задач является выявление клинически значимых маркеров заболеваний, работающих в разных популяциях, исследователи используют собственную базу генетических исследований и данные зарубежных биобанков.

"Данные этих биобанков мы интерпретируем для нашей популяции. Когда в России будет биобанк, будем преимущественно использовать его", - сказал он.

NGS-секвенирование позволяет значительно сократить время исследования и изучать те маркеры, которые недоступны традиционной ПЦР-диагностике, а также реализовать проект по генеалогическим исследованиям.

"На ПЦР это нельзя было сделать, потому что слишком много маркеров генетических нужно смотреть для оценки происхождения, на NGS это вполне осуществимо", - отметил Полуновский.

Методы NGS (next generation sequencing, геномное секвенирование нового поколения) позволяют секвенировать одновременно множество областей генома, нарушения в которых могут быть связаны с развитием онкологических заболеваний, и выявить все типы мутаций для большого количества генов в одном тесте. Для методов NGS необходимы наборы олигонуклеотидов, коротких фрагментов ДНК, в наборе их может быть несколько сотен тысяч.