Как обычно, пробуем разобраться ситуационно.
Вы являетесь владельцем отдельной квартиры, и приобрели квартиру своего соседа (или в соседней квартире жили Ваши родственники, и она досталась Вам по наследству). Либо, купили две квартиры. Во всех перечисленных выше случаях, способ приобретения этих объектов недвижимости - значения не имеет. Самое важное - наличие законной, технической возможности, объединить такие две квартиры в одну, и Вы, это намерение, реализовали.
В результате объединения, существование старых объектов недвижимости (двух отдельных квартир) прекратилось, но образовался новый объект недвижимости (одна большая квартира).
В соответствии со ст. 219 ГК РФ, право собственности на вновь создаваемое недвижимое имущество, подлежащее государственной регистрации, возникает с момента такой регистрации.
Как следствие, сроки владения на обе старые квартиры, с момента прекращения их существования, для целей налогообложения - не имеют значения, и не применяются. Срок владения н