Марина Михайловна Малинина родилась в Москве 28-го (15-го по старому стилю) марта 1912 года. Её родителями были педагог Анна Спиридоновна (в девичестве Любатович; 25 июля 1882– ?) и оперный певец Михаил Дмитриевич (1853-1919). Когда родилась Марина, отец преподавал пение на дому, в музыкальной школе Конюс и драматической школе Халютиной; мать работала в мужской и женской гимназиях Вязьмы. Осенью 1912 года Анну Спиридоновну перевели в Шелапутинскую гимназию и реальное училище общества преподавателей в Москве.
За четыре года до появления Марины на свет в семье родился сын Роман (1908-1989). От первого брака у Михаила Малинина был ещё сын Борис (1889-1949) – конструктор подводных лодок. Он поддерживал отношения со знаменитой единокровной сестрой и встречал её в Москве из рекордного перелёта на Дальний Восток.
В своё время Михаил Дмитриевич выступал в частной опере Саввы Мамонтова, Анна Спиридоновна преподавала французский язык. Она занималась языками и с дочерью: та в анкете от 1 июля 1934 года указала, что может объясняться на французском и читать на немецком со словарём.
В августе 1919 года Михаил Дмитриевич выходил из трамвая на Сухаревском рынке и был сбит мотоциклом. В бессознательном состоянии его доставили в Ново-Басманную больницу, куда Анна Спиридоновна приходила через день, а Рома с Мариной – один раз, незадолго до его смерти. Через три недели после ДТП, в сентябре 1919 года, Михаил Малинин скончался. Отпевание прошло в больничной церкви. Марина оставила запись в дневнике об этой своей потере восемь лет спустя: «Когда я узнала, что папа умер, я мысленно перенеслась в раннее детство, на широкий диван, в царство царевен – черепах и лягушек, но понять сознательно, что случилось, я не могла. Не могла также понять ничего я и тогда, когда стояла в церкви больницы. Папа лежал в гробу такой весёлый и всё улыбался. Я отошла от гроба и думала: зачем все плачут о нём, ведь он улыбается?.. Дальше помню кладбище. Гроб опустили. А я всё думала, что папа сейчас встанет и скажет: «Ну, братцы мои, что же это вы!...». Но вот гроб стали засыпать землёй, а я всё думала: ну, скоро он встанет… Ведь он так смотрел на меня из гроба, будто подмигивал мне, что, мол, «уж и шутку же мы над ними подшутили!..» Но засыпали холм и все пошли домой, а я всё оборачивалась и смотрела: где же папа?».
От Михаила Дмитриевича семье остались старый рояль, часы и одежда, которую Анна Спиридоновна перешила Роме, а через некоторое время её донашивала Марина. Чтобы снизить расходы, мать окончила сапожные курсы и сама делала детям обувь.
