Программу для генетической диагностики онкологии разработали в Новосибирске

Специалисты Новосибирского государственного университета (НГУ) разработали программу дизайна коротких последовательностей ДНК для геномного секвенирования нового поколения. Об этом рассказала руководитель центра компетенций «Биотехнологии и микрофлюидика» ПИШ НГУ Ольга Науменко.

— Для выявления нарушений генов на данный момент наиболее целесообразным является использование методов NGS-секвенирования. Данные методы позволяют секвенировать одновременно множество областей генома, нарушения в которых могут быть связаны с развитием онкологических заболеваний, и выявить все типы мутаций для большого количества генов в одном тесте, — объяснила Ольга Науменко.

Глава центра также отметила, что для методов NGS необходимы наборы олигонуклеотидов – коротких фрагментов ДНК, количество которых может составлять несколько сотен тысяч.

Науменко пояснила, что в ПИШ НГУ разработали программу «Олигодизайнер», которая позволяет проектировать олигонуклеотиды для исследования интересующих врачей участков генома с целью диагностики.

Эта программа может использоваться в онкологических центрах, где с ее помощью создается файл с необходимыми нуклеотидными последовательностями и передается в лабораторию для синтеза. Кроме того, существует возможность создания улучшенных вариантов олигонуклеотидов.

Однако, как подчеркнула Науменко, на данный момент в России нуклеотиды для NGS-секвенирования не синтезируются.

Глава центра также добавила, что NGS-секвенирование может использоваться не только для онкодиагностики.

Ранее «Прецедент» сообщал, что в Новосибирской области второй год подряд снижается смертность.

Егор САФРОНОВ