В числе важнейших изменений — восьмиступенчатая автоматическая коробка передач Gazoo Racing Direct, созданная специально под характер GR Yaris. Система, дебютировавшая с прошлогодним обновлением, стала альтернативой традиционной шестиступенчатой «механике». После обкатки в реальных условиях этот «автомат» подвергся корректировке: настройки обновлены, особенно в спортивном режиме, что позволило ускорить переход на пониженные передачи, в особенности между второй и первой ступенью. При движении в гору коробка стала дольше удерживать двигатель в зоне пиковых оборотов, не торопясь переключаться вверх, что позволяет сохранять мощность и темп. Кроме того, в салоне увеличили площадку для отдыха левой ноги, сделав вождение более комфортным. Ещё одной новостью стал вертикальный ручной тормоз в духе раллийных машин — теперь его можно заказать как опцию вне зависимости от трансмиссии. Независимо от комплектации, в оснащение по умолчанию теперь входит комплекс систем помощи водителю Toyota Safety S