Специалисты Института персонализированной онкологии Сеченовского университета совместно с зарубежными коллегами разработали компьютерную модель, позволяющую в автоматическом режиме реконструировать тысячи внутриклеточных молекулярных путей.
Новая методика позволяет спрогнозировать дальнейшее развитие болезни и выбрать оптимальную стратегию лечения. Это стало возможным благодаря оценке работы как индивидуальных генов, так и генетических «ансамблей».
«Процесс превращения нормальной клетки в раковую сопровождается мощной перестройкой работы генома. Эти изменения, как правило, затрагивают от трех тысяч генов и более. Их функционирование можно рассматривать как индивидуально, так и в контексте биологических процессов, за которые они отвечают», — пояснил главный научный сотрудник Института персонализированной онкологии Сеченовского университета, доктор биологических наук Антон Буздин.
Модель анализирует совокупность всех взаимодействующих молекул, которые находятся в раковой клетке, прежде всего белковых.
Ученые проверили эффективность работы нового метода, сравнив его с другими. Для этого они проанализировали более девяти тысяч образцов опухолей, суммарно — 21 вид рака. Результаты оправдали себя. Кроме того, они получились с минимальными искажениями и меньшей вероятностью ошибки.
«Количество и качество онкомаркеров, получаемых с помощью нового алгоритма, гораздо выше по сравнению с используемыми сейчас при анализе активности индивидуальных генов. Благодаря быстроте работы и полноте отражения внутриклеточных молекулярных процессов в клетке данная модель может стать надежным инструментом для персонализированной диагностики онкологических заболеваний и для прогнозирования выживаемости пациентов», — заключил Антон Буздин.