Проект был начат в 2107 году. Стоимость всех исследований составила почти 400 миллионов долларов. Атлас детально описывает местоположение и функции 3300 различных типов мозговых клеток, значительно расширяя наши знания о структуре и функциях мозга. Этот перечень включает в себя не только нейроны, которые осуществляют обмен химическими и электрическими сигналами в мозге, но и многочисленные ненейронные клетки (вспомогательные клетки нервных тканей мозга).
Ненейронные клетки, такие как глия, выполняют важные функции, например, такие как поддержание структуры мозга, поставку питательных веществ и изоляцию нейронов, а также регулирование передачи сигналов. В целом, мозг взрослого человека содержит около 86 миллиардов нейронов и еще около 84 миллиардов ненейронных клеток. В создании атласа использовались современнейшие методы, включающие транскриптомику, которая позволяет распознавать все виды РНК отдельных клеток, а также эпигеномику, позволяющую исследовать химические сигналы, которы