В день нападения немцев на Советский Союз Михаил Пуговкин находился на съемочной площадке. Он был задействован в небольшом эпизоде фильма «Дело Артамоновых».
Спустя 2 недели Михаил на фронте. Ему должно были исполниться 18 лет только 13 июля, но он добавил себе 1 год, что позволило записаться добровольцем. Так Пуговкин оказался в московском ополчении.
Сначала они рыли окопы, возводя укрепрайон. Затем дивизию перебросили под Смоленск, а далее – под Вязьму. Наконец, Михаил попал на Дон.
Немцы взяли Таганрог и двигались на Ростов-на-Дону. 21 ноября 1941 г. враг смог взять город, но продержался в нем только 8 дней. Красная Армия смогла его отбить, что стало одной из первых значительных побед в той войне.
Михаил участвовал в освобождении Ростова-на-Дону. После рядового Пуговкина зачислили в разведку. Спустя некоторое время он получил звание старшего сержанта.
В конце июня 1942 г. недалеко от Михаила взорвался снаряд. Осколки попали в ногу. В медсанбате их извлекли, но возникла опасность гангрены. Когда Пуговкин находился уже в госпитале, вышла директива Сталина, которая спасла его.
В то тяжелое время нашим солдатам отрезали руки и ноги на раз два. Таким образом спасали их жизни. Эта же участь ждала и Пуговкина. Но в новой сталинской директиве указывалось, что врачи должны свести к минимуму количество ампутаций. Понятно, что никто не хотел рисковать.
Поэтому врач, оперировавший Михаила, взял обычную ложку, раскалил ее и использовал как «черпак», чтобы очистить рану. Затем все зашил, и Пуговкина отнесли в палату. В результате удалось избежать гангрены и сохранить ногу.
Осенью 1942 г. Михаила комиссовали. Он вернулся в Москву, где устроился на работу в Московский театр драмы.
В 1943 г. Пуговкин поступает в школу-студию при МХАТе.
В 1944 г. Михаил вновь призвали на армию. Так он оказался в танковом училище, где прослужил до лета 1945 г. Начальник этого заведения был неравнодушен к деятелям искусства. Сначала он определил Пуговкина в художественную самодеятельность, а затем и вовсе отчислил, чтобы не пропадал талант.
На этом военная служба завершилась окончательно. К зиме 1945 г. Михаил вернулся к учебе в школе-студии при МХАТе.