В последнее время — с помощью электронного документооборота (ЭДО). Для пересылки я использую Диадок. А для того, чтобы ставить электронную подпись, — специальную флэшку с токеном, которую получил в МФЦ как ИП на упрощёнке (я работаю как индивидуальный предприниматель с 2011 года).
Если документ требует обсуждений и многоэтапных согласований (например, это может касаться приложений к договорам), я создаю его в гугл.доках, скидываю клиенту ссылку и мы вместе обсуждаем, комментируем и правим его в режиме онлайн.
Затем я экспортирую готовый документ к себе на компьютер и сохраняю в специальной папке, где для порядка храню всю документацию, разбитую по годам, видам деятельности и клиентам.
После этого я отправляю документ клиенту и прошу подписать его и отправить мне в Диадок (потому что исходящие отправки стоят денег, и я так ни разу и не оказался в ситуации, когда у клиента нет оплаченной системы ЭДО и платить нужно мне; а вот входящие документы — бесплатны).
Так мы пересылаем и подпи