На первый взгляд разницы нет. Доказательства существования в прошлом Монгольской империи бесчисленны, неоспоримы, но – даже если вдруг (ну, вдруг) известны ведущим полемику вокруг данной темы, то могут считаться сфальсифицированными. С другой стороны, доказательства реальности Великой Тартарии (или Страны Свята Расы, Империи Славян, или ещё как-то) – тоже бесчисленны. Просто они скрываются наукой, инопланетянами, а – в тяжёлых случаях, – ещё и коммунальными службами.
Тем не менее, разница есть.
Как отмечено в комментарии, Монгольская империя развалилась. De facto уже при сыновьях Темучжина, de jure – чуть позже. Развалилась по понятным причинам. Потому что была слишком велика для транспортной, военной и, как следствие, политической связности частей. То же, – и по тем же причинам, – как известно, произошло и с империей Александра Македонского.
«Понятные причины» – здесь ключевые слова. Если древние империи фигурирующие в официальной истории и выдуманы, они выдуманы качественнее. Достаточно подробно, чтобы существовать по законам мира, частью которого являются.
Империи же фигурирующие в истории альтернативной – и выдуманы кое-как.