Найти в Дзене
Диаэм

Клеточная биология в формате Single Cell. Современные подходы в работе с 3D-культурами клеток

Эта публикация отражает содержание второй части вебинара «Клеточная биология в формате Single Cell», состоявшегося 11 октября 2022 г. в рамках проекта «Онлайн-лекторий Диаэм». Сфероиды: из истории – в современность Сфероиды – трехмерные агрегаты клеток размером 50-500 мкм, в которых проявляется обширная межклеточная адгезия; обычно такие структуры сохраняют свой эндогенный внеклеточный матрикс и обладают свойствами, сходными с их тканевыми аналогами invivo. В отличие от 2D-среды, 3D-культура клеток позволяет им расти, как в естественных условиях – во всех направлениях. История сфероида не нова: это не совсем современное понятие, первое упоминание о сфероидах датируется 1912 годом, когда Алексис Каррель, работая с клетками сердца эмбриона цыпленка, получил агрегаты клеток, способные самоорганизовываться. Только спустя почти полвека – в начале 50-х гг. – Джозеф Лейтон доработал метод Карреля, используя губчатую подложку как субстрат, с помощью которого клетки собирались в трехмерную стру
Оглавление

Эта публикация отражает содержание второй части вебинара «Клеточная биология в формате Single Cell», состоявшегося 11 октября 2022 г. в рамках проекта «Онлайн-лекторий Диаэм».

Специалист «Диаэм» Сергей Ирхин рассказал о технологиях изоляции клеток, реализованной в системах Nadia от компании DolomiteBio, для дальнейшего изучения транскриптома на уровне единичных клеток. Этот вебинар раскрывает роль микрофлюидики в экспериментах с 3D-культурами.
Специалист «Диаэм» Сергей Ирхин рассказал о технологиях изоляции клеток, реализованной в системах Nadia от компании DolomiteBio, для дальнейшего изучения транскриптома на уровне единичных клеток. Этот вебинар раскрывает роль микрофлюидики в экспериментах с 3D-культурами.

Сфероиды: из истории – в современность

Сфероиды – трехмерные агрегаты клеток размером 50-500 мкм, в которых проявляется обширная межклеточная адгезия; обычно такие структуры сохраняют свой эндогенный внеклеточный матрикс и обладают свойствами, сходными с их тканевыми аналогами invivo. В отличие от 2D-среды, 3D-культура клеток позволяет им расти, как в естественных условиях – во всех направлениях.

История сфероида не нова: это не совсем современное понятие, первое упоминание о сфероидах датируется 1912 годом, когда Алексис Каррель, работая с клетками сердца эмбриона цыпленка, получил агрегаты клеток, способные самоорганизовываться. Только спустя почти полвека – в начале 50-х гг. – Джозеф Лейтон доработал метод Карреля, используя губчатую подложку как субстрат, с помощью которого клетки собирались в трехмерную структуру.

В 1971 г. появились сообщения о том, что в суспензионной культуре опухолевые клетки проявили способность к спонтанному формированию округлых многоклеточных микроагрегатов. Тогда они и получили название сфероидов.

Преимущества сфероидных культур

Чем же хороша сфероидная культура для исследователей и почему она лучше классической двухмерной?
Чем же хороша сфероидная культура для исследователей и почему она лучше классической двухмерной?

В сфероиде наблюдается более сложное взаимодействие между клетками, ведь клетки в этом случае взаимодействуют не только с соседями слева и справа, спереди и сзади, но еще и сверху, и снизу, то есть они находятся в неком микроокружении, влияя друг на друга.

Это позволяет изучать и моноклональные сфероиды, когда вся формация состоит из клеток-потомков одной клетки-предшественницы, и формировать гетерогенные «сообщества» – конструкции, в которых разные типы клеток сформировали некий агрегат, проявляющий определенные свойства.

Вариантов применения таких свойств сфероидов много.

Использование 3D-культур как модели для проведения скрининга фармпрепаратов invitro, потому что по сравнению с классическими моделями здесь можно выявить какие-то более тонкие явления и взаимодействия. Клетки в объемной структуре ведут себя немного по-другому, их поведение максимально приближено к поведению invivo, что дает возможность получить более-менее объективные результаты такого тестирования препарата или оценить его эффективность. Понятно, что при тестировании на плоской культуре нет гарантии, что в организме воздействия препарата проявится точно так же (и с точки зрения эффективности, и с точки зрения оценки токсичности).

Второй вариант – еще более популярный, чем первый: опухолевые сфероиды стали практически идеальной моделью для тестирования онкопрепаратов invitro для оценки воздействия онкопрепарата на культуру клеток. Можно создать сфероид из нескольких типов опухолевых клеток – гетерогенный сфероид, на котором можно оценить влияние препарата на гетерогенную опухоль. Это важно, поскольку бывают случаи, когда, подавляя препаратом один вид клеток в сфероиде, исследователь тем самым освобождает место для роста опухолевых клеток другой группы. Понятно, что если перенести этот процесс на организм человека, шансы на ремиссию получатся очень сомнительными, а следовательно, эффективность препарата с такими свойствами тоже останется под вопросом.

И конечно, применение сфероидов открывает новые горизонты в трансплантологии, потому что 3D-культуры человеческих мультипотентных стволовых клеток – это отличное решение для трансплантологии, для репарации каких-то поврежденных тканей, ликвидации тканевых дефектов, например, наращивания кости в случае утери фрагмента после сложных операций или обширных травм. Это хорошее решение: сфероиды заносят в некий ячеистый скаффолд, где клетки отлично и очень быстро разрастаются. Это популярное применение сфероидов, о чем свидетельствует множество опубликованных работ.

Шесть подходов к созданию сфероида

Методик создания сфероидов много, и у каждого варианта есть свои недостатки и достоинства.

  1. Самый простой и популярный – метод висящей капли: каплю суспензии клеток подвешивают к крышечке чашки Петри и в таком положении она висит. Клеткам в ней некуда деваться, и они начинают взаимодействовать между собой, образуя 3D-агрегат.
  2. Альтернатива – создание сфероида в микролунках, но поверхность таких микролунок должна обладать ультранизкой адгезией, потому что иначе клетки по ней распластаются. Принцип здесь тот же самый: клетки «сползаются» к нижней точке лунки и начинают формировать агрегаты.
  3. Еще один подход – создание сфероидов во вращающемся сосуде – пригоден только для клеток, способных спонтанно образовывать такие агрегаты, то есть не для всех типов клеток. Тем не менее этот метод довольно прост, хотя и характеризуется немалой трудоемкостью процесса, а образующиеся агрегаты клеток получаются гетерогенными по размеру.
  4. Создание сфероидов с использованием матрикса – метод довольно простой, но в свете последних событий стало трудно достать сам по себе матригель и подобные реактивы (внеклеточные матриксы) стало трудно достать.
  5. Есть еще «экзотические» методы вроде использования магнитных наноносителей, когда в клеточку внедряются различные наночастицы с магнитными свойствами, а потом с помощью магнита эти клетки вылавливаются и формирование сфероида происходит за счет взаимного притяжения клеток.
  6. Шестому методу – микрофлюидному – посвящена основная часть этого доклада.

Подробнее в статье на нашем сайте.