В июле 1998 года было принято решение сворачивать производство, а 25 августа остановился конвейер. Официально выпуск автомобилей окончился в 1999 году. Тем не менее, мелкосерийное производство продолжалось вплоть до начала 2000 года, это были спецсерии: бронированные Sonderschutz и удлинённые лимузины Pullman. В конце 1998 года на смену S-классу W140 пришёл новый автомобиль Mercedes-Benz W220, а купе, выделенное в 1996-м году в отдельный CL-класс, заменила модель Mercedes-Benz C215.
Обновления и увеличенные объёмы производства и продаж к концу 1990-х годов так и не помогли W140 повторить успех модели W126. Количество выпущенных единиц серии составило чуть более 400 тысяч для 140-ой серии против более 800 тысяч 126-ой. Тем не менее, значение S-класса W140 для марки Mercedes-Benz сложно переоценить. Один из самых крупных и тяжелых автомобилей автомобиль-символ и эталон представительского класса (сегмент F) задал своеобразный стандарт и утвердил лидерство немецкого бренда в сегменте на годы вперёд. В печатном издании «Frankfurter Allgemeine Zeitung» от 25 августа 1998 года под заголовком «Конец хорошего патриарха» прозвучало сентиментальное прощание следующего содержания: «S-класс всегда был лучше, чем его репутация». В этот некролог, написанный Вольфгангом Петерсом, вошли следующие строки: «... Никакая другая машина не предлагала такой комфорт и подвеску для езды, и ни один другой автомобиль в этой категории не мог бы управляться с такой безопасностью и с такой маневренностью в одно и то же время. S-класс был гигантом, которого учили танцевать на пальцах ног».