На начало войны на заводе работали 437 судоремонтников и 400 строительных рабочих. Станочный парк состоял из 162 станков. Более 500 тружеников с первых дней начала войны ушли на фронт защищать нашу Родину. Их рабочие места занимали матери и сестры. Все заводы и мастерские области были переданы в управление техотдела Северного флота. Главное внимание было направлено на выполнение оперативных заданий командования.
В сжатые сроки заводу нужно было переключиться на выполнение главной задачи – перенастройку всех цехов и других структур на работы для нужд фронта, на установку вооружения на гражданские суда, ремонт поврежденной боевой техники на кораблях ВМФ СССР и техники союзных конвоев, изготовление вооружения и боеприпасов. В 1941 году завод получил задание по установке вооружения на ледоколах «Ермак», «Иосиф Сталин», «Молотов», а также на судах ледокольного типа «Сибиряков», «Малыгин», «Русанов». Приложив максимум усилий, эти судна были полностью оснащены военным оборудованием и ушли от причалов завода как боевые корабли.
Для защиты и обороны завода были созданы группы самозащиты из состава противопожарных, санитарных и химических звеньев, сформирован отряд рабочего ополчения для борьбы с десантом противника и обороны северной части поселка, созданы формирования МПВО.
Было организовано производство минометов М-50, отливка и механическая обработка гранат Ф-1, а также спроектирован малый бессемеровский конвертер для выплавки стали и создана сталелитейная печь.
На подкрепление Северному флоту 15 июля 1942 года из Тихого океана вышли боевые корабли: лидер эсминцев "Баку", эсминцы "Разумный" и "Разъяренный". Проделав трудный трехмесячный переход, они не смогли сразу принять участие в боевых операциях. Потребовался срочный ремонт. На заводе заменили ледовые винты и демонтировали защитную обшивку корпуса. От причала завода корабли сразу ушли на боевое задание. Кроме того, завод выполнил большой объем работ на подводных лодках типа "С", «Щ", "Л" и "К".
В 1943 году завод выполнил ответственное задание для фронта. К причалу завода пришвартовался лесовоз "Фрунзе". Судоремонтники приступили к выполнению работы по переоборудованию судна. За короткий срок «Фрунзе» был сдан флоту как танкер. Также в 1943 году, проявив мужество и героизм, под непрерывным обстрелом и бомбежкой, коллектив завода дважды завоевывал переходящее Красное знамя, учрежденное Военным Советом Северного Флота.
В I944-1945 годах новаторы завода приняли самое широкое участие по монтажу на военные корабли Северного флота ракетных минометов "Катюша".
За доблестный труд в период Великой Отечественной войны наши труженики награждались правительственными наградами. 60 человек награждены орденами и медалями СССР, 27 человек - значками "Отличник военно-морского флота".
Всего с начала войны по 28 мая 1943 года было совершено 2429 авианалета и сброшено 7400 зажигательных авиабомб на территорию завода.
После войны на заводской площади установили Мемориальный комплекс "Павшим в годы Великой Отечественной войны".
На 6 плитах 130 фамилий фронтовиков - тех, кто не вернулся с войны, и чьи имена удалось установить.