Я уже писала о том, что мой онколог просила сделать меня анализ на мутации методом секвенирования.
В начале лечения мне уже делали подобный анализ, но методом ПЦР в крови. В середине лечения я то же самое сделала по клеткам опухоли. Но...врач-онколог сказала, что ряд заболеваний, в том числе рак молочной железы, исследуют не по клеткам, а по крови. Но главное делать не ПЦР, а именно секвенирование.
Анализ я пересдала, но мутацию BRCA 1 и 2 снова ничего не нашли. Врачи считают, что мутация у меня всё же есть, но чтобы её найти, нужно понять, какую искать. Та, которую нашли их не устроила почему-то...
Честно сказать, всё это ставило меня в тупик. Я потратила какое-то время, чтобы добиться минимального понимания, почему могут не находить какую-то мутацию, как они её ищут и что это значит.
Здесь я расскажу вам о том, что такое ДНК, и её мутации.
Для начала вспомним немного школьный курс биологии.
За открытие генной инженерии следует сказать спасибо многим учёным, в том числе Фридриху Мишеру, который в далёком 1962 году в результате опытов выделил из ничем не примечательного гноя некое вещество. Это вещество содержало фосфор и азот и не распадалось под действием фермента желудочного сока.
Новое стойкое вещество получило название - нуклеин.
Затем Эдмунд Уилсон сравнил нуклеин с ранее выделенным хроматином (входит в состав хромосом) и сказал, что они очень похожи. Так зародилось мнение, что нуклеин отвечает за наследственную информацию.
Позже это предположение подтвердил Рихард Альтман, который в 1889 году выделил нуклеиновую кислоту без белковых примесей.
Было установлено, что существует два типа кислот: ДНК и РНК. Произнести их полное наименование довольно сложно, чем-то напоминает название исландского вулкана Эйяфьятлайокюдль. Если же вас не пугают сложности, то дезоксирибонуклеиновая и рибонуклеиновая кислота отвечают за все наши гены.
ДНК состоит из нуклеотидов, которые в свою очередь состоят из сахара, азотистого основания и фосфорной кислоты.
Азотистые основания могут быть следующими: аденин, цитозин, гуамин, тимин. Это выяснили в 1935 году учёные Клейн и Танхаузер. Они смогли расщепить молекулу ДНК.
Интересный факт. В наших клетках молекула ДНК занимает очень мало места благодаря своей скрученности по спирали. Однако если разложить одну молекулу в длину, то она займёт несколько метров.
Прорывным моментом в генной инженерии стал 1953 год, когда Френсис Крик и Джеймс Уотсон предложили модель ДНК в виде двойной спирали. Впрочем, большой вклад в это открытие был сделан учёными: Розалиндой Франклин и Раймондом Гослингом.
В общем, в каждом ядре наших клеток есть молекула ДНК. Она знает всё, что нам нужно и когда это нужно. Эта молекула отвечает примерно за все процессы, которые происходят в нашем организме. Нужен белок? Молекула ДНК, удлиняясь, образует свою копию - молекулу РНК.
Эта молекула РНК плывёт в цитоплазму (это жидкое содержимое наших клеток) и отдаёт приказы от ДНК. Дальше маленькие транспортные РНК выбирают нужные участки аминокислот и подтаскивают их к рибосомам (частички, которые нужны для образования белков). Так постепенно строится нужный белок. Какой белок нужен определяет не мозг, а наша ДНК. Проще говоря, геном - это последовательность расположения тех самых азотистых оснований, которые вместе могут образовывать гены.
У каждого человека есть свои гены (участок ДНК, кодирующий белок), которые передаются по наследству.
Исследование "Геном человека", которое закончилось в 2022 году, показало, что у человека есть 19 969 активных генов. Остальные являются некодирующими элементами цепочки ДНК. Всего у человека 63 494 гена. Удивительно, что последовательность генов людей имеет больше всего общего с рыбой фугу.
И всё было бы прекрасно, если бы не ошибки при репликации, которые называются мутации.
Термин мутация был предложен в 1901 году Хуго де Фризом.
В 1914 году Теодор Бовери предположил, что нарушения в хромосомах могут приводить к возникновению злокачественных опухолей.
В 1927 году Герман Мёллер выяснил, что ионизирующее излучение способно вызывать необратимые мутации клетки.
Этот учёный также доказал, что врачи-рентгенологи должны быть защищены от вредного воздействия аппаратов. До этого, никто не предполагал, что это может быть вредно.
А в 1951 году Герман Мёллер предположил, что мутации могут вызвать развитие злокачественных опухолей.
И тут есть один важный факт. Прямо сейчас в клетках вашего тела происходит тысячи мутаций. И это не опасно для вас. Почему?
Мутации - это естественное состояние клеток, которые эволюционируют под воздействием внешней среды. На практике мутация подразумевает изменение естественного порядка цепочки ДНК. То есть в цепи возникают разрывы или замена азотистых оснований.
Но такие мутации не передаются по наследству и не ощущаются организмом. Всё потому, что у нас есть своя система репарации. Эта система исправляет все ошибки.
Но иногда и она даёт сбой, тогда мутация может закрепиться. Это происходит оттого, что однажды появившаяся мутировавшая клетка, которая не была откорректирована системой репарации, делится и получается вторая такая и так далее.
В 1986 году Роберт Вайнберг выявил ген супрессор. Этот ген отвечает за замедление деления клетки и её гибель. Однако если он мутирует, то это может привести к появлению бессмертных клеток, а это и есть основа опухоли.
Также в нашем организме есть онкогены, то есть гены, активация которых приводит к онкологии.
Данные приведённые ниже были мне предоставлены специалистами лаборатории "Онкоатлас".
Список часто встречающихся мутаций при РМЖ согласно международным клиническим рекомендациям (NCCN, ASCO, ESMO, AOP):
1. PIK3CA. Определение генетических вариантов PIK3CA рекомендовано в клинических рекомендациях для пациентов с гормонозависимым HER2-негативным РМЖ. Частота встречаемости такого нарушения около 35%.
2. BRCA1/2. Определение BRCA1/2 вариантов рекомендовано всем пациентам с раком молочной железы. Частота встречаемости такого нарушения около 5%.
3. NTRK1-3. Определения NTRK1-3 рекомендовано всем пациентам с метастатическим раком молочной железы.
4. MSI/dMMR. Определения MSI/dMMR рекомендовано всем пациентам с метастатическим раком молочной железы.
5. PALB2. Определение PALB2 вариантов может быть рекомендовано всем пациентам с раком молочной железы. Частота встречаемости такого нарушения около 1%.
6. TMB (мутационная нагрузка). Определения TMB рекомендовано всем пациентам с метастатическим раком молочной железы.
7. ESR1. Определение вариантов ESR1 может быть рекомендовано пациентам с гормонозависимым HER2-негативным РМЖ в случае, если рассматривается терапия ингибиторами ароматазы.
8. BRAF p.V600E. Частота встречаемости такого нарушения <1%.
К 2003 году было выявлено более 100 генов, которые могут быть идентифицированы с онкологическими заболеваниями, но...
Помните, что наличие - не равно само заболевание. Человек может заболеть, а может и не заболеть. Наш организм - удивительный и загадочный мир, в котором каждую секунду происходит столько процессов, которые сложно понять и отследить.
Сейчас разрабатываются новые методы борьбы против онкологических заболеваний. И генная инженерия занимает там важное место. Одно из последних разработок - это выращивание здоровых генов в лаборатории, а потом их внедрение в нужный орган или ткани человека с помощью пассивного вируса. Кто знает, может именно это сможет окончательно победить серьёзную болезнь.
Во второй части я расскажу про то, что такое секвенирование, чем оно отличается от ПЦР, и почему не всегда нужно искать мутации в клетках опухоли. Продолжение здесь
Не могла не похвастаться своим первым урожаем. Благодаря Елене и её подробной статье про микрозелень, начала выращивать свою брокколи и рукколу.
Если вы добрались до конца статьи, то вы - настоящий крепкий орешек, которого не пугает наука. Спасибо за внимание🙏