#graph_R
#ggcorrplot
#ggstatsplot
Ранее было показано, как построить корреляцию без пакета corrplot. Но данная корреляция не несла в себе информацию о статистической значимости.
Отобразить статистически значимую корреляцию можно посредством использования двух пакетов: ggstatsplot и ggcorrplot. Предварительно необходимо все бинарные переменные из формата «yes/no» перевести в формат «1/0».
Различия в функциях. Если ggstatsplot автоматически отображает статистически НЕзначимую корреляцию, зачеркивая ячейки, то для ggcorrplot необходимо отдельно посчитать p-value (функция cor_pmat). При этом, для функции ggcorrplot действуют такие же надстройки, как для ggplot2: настройка темы (можно поставить theme_bw()) или же настройка цвета (через scale_fill_gradient2(low = “”, mid = “”, high = “”, midpoint = 0)).
Для удобства восприятия код опубликован на RPubs.