С тех пор, как Дарвин сформулировал свою Теорию, споры и злоупотребления вокруг этой темы не утихают ни на минуту. Людям неприятно думать, что они, их строение, их сознание, их способ мышления и восприятия окружающей действительности — суть следствие в некотором роде хаотических процессов, не контролируемых абсолютно ничем, кроме законов природы.
Термин «теория» в науке означает не то же самое, что в нашей повседневной речи. Предположение на научном языке именуется «гипотезой», а научная теория - это «учение, система идей или принципов. Является совокупностью обобщённых положений, образующих науку или её раздел. Теория выступает как форма синтетического знания, в границах которой отдельные понятия, гипотезы и законы теряют прежнюю автономность и становятся элементами целостной системы». Говоря проще, теория в научном смысле — это система знаний. Не гипотеза, не предположение, не идея. А Теория эволюции — вся совокупность сведений об эволюции, накопленных человечеством.
Древние ископаемые и другие многочисленные свидетельства подтверждают, что организмы со временем эволюционировали. Конечно, никто не наблюдал преобразований организмов воочию, но косвенные доказательства эволюции очевидны и достаточны.
Подтверждение теории Дарвина и самого факта эволюции — далеко не единственная область знания, где учёным приходится оперировать косвенными доказательствами. Так, ни один физик не может воочию увидеть элементарные частицы. Однако ни для кого не оставляет сомнения факт их существования, который подтверждается наблюдением треков частиц в камерах Вильсона. Отсутствие прямых доказательств не делает выводы физиков менее обоснованными.