Начавшаяся Великая Отечественная война потребовала особо подготовленных пилотов-планеристов для выполнения специальных заданий в тылу противника. На основании приказа НО СССР от 4 сентября 1941 года школа пилотов была переформирована в планерную школу ВДВ КА и всю войну занималась подготовкой пилотов-планеристов. Было подготовлено более 600 боевых планеристов. Семь выпускников школы, участников Великой Отечественной войны, удостоены звания Героя Советского Союза, а один из них, Талгат Бегельдинов, удостоен этого звания дважды.
Боевое Знамя училищу было вручено 25 мая 1942 года. 12 декабря 1944 года Постановлением Президиума Верховного Совета СССР училищу вручено Красное Знамя. В 1946 году училище перебазируется в Пугачёв (Саратовская обл.), преобразуется в планерное училище и занимается подготовкой командиров тяжёлых планеров.
В мае 1952-го учебная организация переименована в 160-е военное авиационное училище лётчиков и с осени 1952 года приступила к освоению принципиально новой