Шон Гиббонс (Sean Gibbons) из Вашингтонского университета с коллегами из Австрии и США применил метагеномный анализ образцов кала для оценки состава диеты человека. Разработанная система MEDI (Metagenomic Estimation of Dietary Intake) построена на базе данных более 400 пищевых продуктов и более 300 миллиардов пар оснований генетической информации. Она позволяет с высокой надежностью количественно определить ДНК из пищевых продуктов, даже содержащуюся в исключительно низких количествах (до десяти прочтений на миллион). По этому метагеномному профилю можно определить состав рациона и детализировать поступление в организм различных питательных веществ. Описание методики опубликовано в журнале Nature Metabolism.
В качестве эксперимента исследователи с помощью MEDI с высокой точностью реконструировали диету 365 здоровых детей (в том числе начинавших получать твердую пищу) и взрослых, а также 65 участников двух исследований с контролируемым питанием (когда рацион полностью рассчитан и известен). Кроме того, они построили профили поступления нутриентов, которые хорошо совпадали с данными, полученными при контролируемом рационе, а также без дневников питания выявили особенности диеты, связанные с метаболическим синдромом, в клинической когорте из 533 человек.