Геномы наземных растений

К вопросу о геномах наземных растений

Даже сейчас геномы секвенированы не для всех групп, а если секвенированы, то не собраны.

Первый геном растений, а именно модельного объекта Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. (Magnoliophyta, Цветковые), был опубликован в 2000 году.

Что мы имеем на сегодняшний день:

Моховидные (Bryophyta sensu lato):

Филогенетический постер (система) — BPP, 2023.

Marchantia polymorpha L. — печёночники (Marchantiophyta). Интересный сайт, посвященный маршанции.

Anthoceros agrestis Paton — Антоцеротовые (Anthocerothophyta), также секвенирован A. punctatus L. Сайт, посвященный Антоцеротовым.

Physcomitrella patens (Hedw.) Bruch & Schimp. — мхи (Bryophyta), больше геномов мхов можно найти тут.

Pteridophyta — филогенетический постер (система) — PtPP, 2022.

Плауны (Lycopodiophyta):

Diphasiastrum complanatum (L.) Holub — равноспоровый,
Selaginella moellendorffii Hieron. и Isoetes taiwanensis De Vol — разноспоровые.

Папоротники (Polypodiophyta):

Ceratopteris richardii Brongn., Adiantum capillus-veneris L., Alsophila spinulosa (Wall. ex Hook.) R.M.Tryon — равноспоровые.

Marsilea vestita Hook. & Grev., Azolla filiculoides Lam. и Salvinia cucullata Roxb. — разноспоровые.

Голосеменные (Pinophyta):

Cовременная система голосеменных растений.

Cycas panzhihuaensis L.Zhou & S.Y.Yang — Цикадовые (Cycadales);
Ginkgo biloba L. — единственное нынеживущее Гинкговое (Ginkgoales);
Picea abies (L.) H.Karst. — Хвойные (Pinales);
Thuja plicata Donn ex D.Don — Кипарисовые (Cupressales);
Ephedra sinica Stapf — Хвойниковые (Ephedrales), Welwitschia mirabilis Hook.f. — Вельвичиевые (Welwitschiales), Gnetum gnemon L. — Гнетовые (Gnetales).

Цветковые растения (Magnoliophyta) есть, например, здесь и здесь.

Филогенетический постер (система) — APP VI, 2019;

Некоторые геномные базы данных: TreeGenes, NCBI.

Оригинальный пост: https://t.me/in_plantae_veritas/712

#базы_данных, #геномы_растений